Mine Yoldaş Orhon, MutEXP: Gen Eksprasyonunu Etkilene SNPleri Belirlemek için Bir Araç

Doktora Adayı: Mine Yoldaş Orhon
EABD: Tıp Bilişimi
Tarih: 11.09.2023 / 14:00
Yer: A-212

Özet: Genomdaki varyantların çoğu kodlamayan bölgededir. Kodlayan bölgedeki değişiklikler proteini etkilerken, kodlamayan bölgedeki değişiklikler düzenleyici mekanizmayı etkiler. Bu nedenle kodlamayan varyasyonların gözlemlenmesi, gen ekspresyonunu etkileyen varyasyonların belirlenmesini sağlayabilir. eQTL, gen ifadesine etki eden SNP'lerin belirlenmesi amacıyla kullanılan popüler bir yöntemdir. Somatik SNP'ler ile gen ifadesi arasındaki ilişkiyi eQTL analizine dayalı olarak anlamak için python tabanlı, kullanımı kolay bir araç uyguladık.