Kamran Karimov, Primeri Bilinmeyen Kanserlerin Primer Dokularının Makine Öğrenmesi Yöntemleri ile Tahmini

Yüksek Lisans Adayı: Kamran Karimov
EABD: Biyoenformatik
Tarih: 18.01.2024 / 11:00
Yer: A-108

Özet: Primeri Bilinmeyen Kanserler (PBK), tümörün birincil kaynağının tespit edilemediği ve yalnızca ikincil tümörün belirgin olduğu metastazlardır. Köken doku tümörün temel özelliklerini tanımladığından ve çoğu tedavi yöntemi bu özelliklere özgü olduğundan, bu durum tedavide sorunlara neden olabilmektedir. Primer tümör ve onun metastazları arasındaki gen anlatım profili benzerliklerine dayanarak PBK’ların primer dokusunu tahmin etmek için üç farklı makine öğrenmesi modeli oluşturduk. Modeller, TCGA programından elde edilen 14 farklı kanser türünde 8798 kanser vakası üzerinde eğitilmektedir. Kullanılan verilerde spesifik kanser türleri belirlidir. Süreç boyunca belirli gen tiplerine dayalı olarak köken tahminini denedik, bu sonuçları birbirleriyle ve genel doğrulukla karşılaştırdık. Kurulan model, daha fazla veri sayesinde geliştirilirse PBK teşhislerine yardımcı olabilir.