Yüksek Lisans Adayı: Yavuzhan Çakır

EABD: Biyoinformatik

Tarih: 23.07.2024 / 15:00

Yer: A-212

Özet: SARS-CoV-2 virüsünün neden olduğu COVID-19 pandemisi, hastalığa yatkınlığı etkileyen genetik faktörleri anlama ihtiyacının altını çizmiştir. Bu çalışma, Hacettepe Üniversitesi Hastanesi'ndeki hastaları kullanarak Türk toplumunda Tek Nükleotid Polimorfizmleri (SNP'ler) ile COVID-19 duyarlılığı arasındaki ilişkiyi aydınlatmayı amaçlamaktadır. Bu çalışma, COVID-19 duyarlılığı ile bağlantılı SNP'leri tanımlamak ve analiz etmek için veri odaklı bir yaklaşım benimsemektedir. Yeni nesil dizileme kullanarak, Türkiye'deki Hacettepe Üniversitesi Hastanesi'nde tedavi gören hastalara odaklanarak, çeşitli bilimsel yayınlardan SNP verilerini sistematik olarak derledik ve analiz ettik. Analiz, varyant arama, bağlantı analizi ve Finlandiya dışı Avrupa alel frekansları ile istatistiksel karşılaştırmaları içermektedir. Temel bulgular, varyantların (rs17860115, rs2298659, rs2298661, rs4290734, rs9271609, rs2532300, rs34624090, rs61299115 ve rs56106917) Avrupa popülasyonuna kıyasla farklı frekanslar sergilediğini ve Türkiye'de hastanede yatan popülasyonda hastalık duyarlılığını etkileyen potansiyel genetik yatkınlıkları gösterdiğini öne sürmektedir. Bağlantı dengesizliği analizi, belirli genetik lokuslar arasındaki güçlü korelasyonları vurgulayarak kalıtsal modellere işaret etmiştir. Çalışma, Avrupa'daki alel frekanslarından farklı olarak, Türk nüfusu içerisinde COVID-19 duyarlılığı ile ilişkili önemli genetik varyasyonları vurgulamaktadır. Bu bulgular, halk sağlığı stratejilerinde genetik çeşitliliğin dikkate alınmasının önemini vurgulamakta ve hastalığa yatkınlık ve şiddeti etkileyebilecek genetik faktörlere ilişkin anlayışımızı geliştirmektedir. Bu ilişkileri doğrulamak ve hastalık yönetimi ve önleme stratejileri üzerindeki etkilerini araştırmak için daha büyük kohortlarla daha fazla araştırma yapılması önerilmektedir.