Yüksek Lisans Adayı: Cansu Dinçer
EABD: Sağlık Bilişimi / Biyoenformatik Yüksek Lisans Programı
Tarih: 28.08.2019 / 11:00
Yer: A-212

Özet: Glioblastoma multiforme (GBM), en agresif seyirli, heterojen beyin tümörü çeşididir. Bu heterojenlik verimli tedavi yöntemlerinin geliştirilmesinin önündeki temel engeldir. Bu çalışmada, TCGA’ de bulunan GBM hastalarının mutasyon profillerini kullanarak, hastalar arasındaki çeşitliliği azaltmayı, hastaları gruplara ayırıp, gruplara has ilaçların ve grupların ilaca tepkilerinin çıkarımını yapabilmeyi amaçlıyoruz. Bu nedenle, hasta mutasyonlarına onların biyofiziksel karakterlerini ve hastaya özgü ağlardaki organizasyonlarını kullanan sistemsel bir yaklaşım uyguladık. Üç boyutlu mutasyon birikim bölgelerini belirleyerek hasta çeşitliliğini azaltırken, ağ temelli yaklaşımla hastaları beş farklı gruba ayırdık. Bu hasta gruplarından her biri belirli üç boyutlu mutasyon birikim bölgeleri taşıdıklarından, bu mutasyon birikim bölge bilgisini GBM hücre hattı mutasyon ve ilaç hassasiyet verileri ile birleştirerek, hasta gruplarımızı hücre hatlarına ve en son ilaçlara bağladık. Böylece hasta gruplarımızın belirli ilaçlara verebilecekleri tepkileri önerdik. Örneğin, CSF1R’ ı hedefleyen Pazopanib Grup 3 için etkili olabilecekken, Grup 2 ATM’ yi engelleyici ilaçlara karşı dirençli olabilir. Sonuç olarak, mutasyon, protein etkileşim ağları ve ilaç verileri kullanarak yapmış olduğumuz bu çalışma kişiye özel, hassa tıp çalışmalarına yeni bir bakış açısı olabilir.