Yüksek Lisans Adayı: Ramal Hüseynov

EABD: Biyoinformatik

Tarih: 13.01.2026 / 11:00

Yer: A-212

Özet: Somatik mutasyonlar, normal hücrelerin kansere dönüşümünü tetikler. Bununla birlikte, seçici bir büyüme avantajı sağlayan sürücü mutasyonları, nötr yolcu mutasyonlarının geniş arka planından ayırt etmek kritik bir zorluk olmaya devam etmektedir. Bunu ele almak için, uzun menzilli genomik etkileşim verilerinden yararlanarak mutasyon merkezli ağlar oluşturan yeni bir grafik tabanlı çerçeve sunuyoruz. Yöntemimiz, genomik aralıkları düğümler ve uzun menzilli etkileşimlerini veya örtüşmelerini kenarlar olarak modeller. Bir ’çekirdek’ mutasyondan başlayarak, grafik yinelemeli olarak genişler ve hem yerel hem de uzak genomik bağlamı yakalamak için örtüşmeleri ve etkileşimli aralıkları bulur. Bu mimari, bir mutasyonun topolojik etkisini nicelleştirmemize, karmaşık yapısal kalıpları (grafik döngüleri gibi) tanımlamamıza ve değişken aralıklarda bilinen sürücü genlere yakınlığı değerlendirmemize olanak tanır. Dahası, bu yaklaşım doğal olarak bireysel mutasyonlar için gömme vektörleri oluşturarak, örneklerin mutasyon profili benzerliğine göre kümelenmesini sağlar. Sonuç olarak, genomik manzaraya kapsamlı, etkileşim odaklı bir bakış açısı sağlayarak, çerçevemiz daha doğru sürücü tanımlamasını ve kişiselleştirilmiş tedavi için iyileştirilmiş hasta sınıflandırmasını kolaylaştırır.