Lütfen tablodaki tarih, saat ve sınıf bilgilerine uyunuz. OİBS üzerindeki bilgiler sistemsel hatalardan dolayı doğru olmayabilir. 

Eksik derslere ait bilgiler iletildikçe, liste güncellenmektedir. 

ODTÜ Enformatik Enstitüsü'nün aylık Cuma Seminerlerinin ikinci konuşması ODTÜ Enformatik Enstitüsü Sağlık Bilişim Programından Prof. Dr. Rengül Çetin-Atalay tarafından verilecektir:

“Biyoinformatik Yoluyla Kanserde Kişiselleştirilmiş Tıp”.

Yer: Enformatik Enstitüsü Konferans Salonu 124

Zaman: 4 Mayıs 2018, 15:30-16:30.

This seminar is open to public and those outside METU have to register from here.

Abstract: Due to the recent advances in molecular biology and the applications of optoelectronic sensors, the volume of biological data in biomedical research has increased significantly. We now acquire large data sets which provides the novel insights for the biology of a disease, in particular for cancer which is recently reported as the most-deadly disease by WHO. The analysis of the molecular characteristics of a patient’s disease through computational tools allows patient stratification for better healthcare which is tailored for personalized prevention, diagnosis, and treatment. In this talk I will summarize recent advances on personalized cancer medicine with a special focus on related KanSiLab studies.

Short Bio: Dr. Rengul Cetin-Atalay holds MD degree and PhD degree in Systems Biology and her research falls in the broad fields of pathway analysis, bioinformatics and biomedical-image analysis and specifically in molecular cellular biology of primary liver cancer. She worked as a research assistant at Ecole Polytechnique, Paris, France during her PhD, and as an assistant professor at Virginia Bioinformatics Institute, Virginia Polytechnic Institute and State University (Virginia Tech), USA during her sabbatical leave in 2004.  She is the recipient of several awards including Turkish Academy of Sciences Young Investigator Award (2002), UICC International Cancer Technology Transfer Award (2008), and Sanovel Pharmaceuticals Inc, Drug Research Award (2013). During the last decade, she extended her studies on the discovery of novel chemotherapeutics for liver cancer by the application of computational techniques on the analysis of pharmaco-transcriptomics data.  Her experience in the interdisciplinary research approach in cancer biology with various aspects of this disease, devotes  her research towards personalized medicine.

Bilişim Sistemleri EABD Yüksek Lisans Programı öğrencisi Mehmet Erdem Örs, "MOBİL ÖDEME TEKNOLOJİSİNİN KABULÜ: LİTERATÜR TARAMASI VE MODEL ÖNERİSİ" konulu tezini, 05 Mayıs 2018 tarihinde saat 15:00'da A-108 no.lu toplantı salonunda savunacaktır.

Tez Özeti : Bu tez çalışması, mobil ödeme sistemlerinin kabulünü ayrıntılı biçimde inceleyerek, bir teknoloji kabul modeli geliştirmeyi hedeflemektedir. Bu çalışma iki ana kısımdan oluşmaktadır. Tez çalışmasının ilk kısmında, mobil ödeme sistemlerinin kabulü detaylı olarak incelenmiştir. İkinci kısımda, bir teknoloji kabul modeli, literatür taramasının sonuçları kullanılarak geliştirilmiştir. İlgili literatür 2005 yılından 2018 yılının Mart ayı sonuna kadar taranmıştır. Literatür taraması ile çalışmaların yeri, örneklem büyüklüğü, teorik dayanakları, araştırma yöntemleri, istatistiksel analizleri, model elementleri ve model ilişkileri hakkındaki bilgiler sağlanmıştır. Literatür taramasının sonucunda, 11 faktör elde edilmiştir. Çıkarılan faktörler, uzman grup tarafından incelenerek onaylanmıştır. Daha sonrasında, literatür taramasının sonuçlarına dayanarak bir teknoloji kabul modeli önerilmiştir. Modelde yer alan hipotezleri test etmek için, bir anket oluşturulmuştur. Anket ile 378 katılımcıdan bilgi toplanmıştır, ancak 302 katılımcıdan toplanan veri çalışma kapsamında kullanılmıştır. Model, “Kısmi en küçük kareler – Yapısal Denklem Modeli” (PLS-SEM) yöntemi ile test edilmiştir. Sonuçlar elde edildikten sonra, faktörler arası ilişkiler literatürden alınarak modele eklenmiştir. Sonuç olarak, modelin son hali oluşturulmuştur. Sonuçlar anket katılımcıları ile yapılan görüşmeler ile desteklenerek raporlanmıştır. Çalışmanın bulguları mobil ödeme sistemlerin kabulünün en çok kullanışlılık ve uyumluluk faktörlerinden etkilendiğini göstermektedir.

Bilişim Sistemleri EABD Doktora Programı öğrencisi Murat Salmanoğlu, "ÇEVİK YAKLAŞIMLAR KULLANAN YAZILIM ORGANİZASYONLARI İÇİN PRATİK BİR ÖLÇÜM YETENEĞİ MODELİ" konulu tezini, 16 Nisan 2018 tarihinde saat 09:00'da Konferans-1 salonunda savunacaktır.

Tez Özeti : Ölçüm, başarılı yazılım yönetimi için temeldir. Ancak, yazılım organizasyonları için ölçüm aktivitelerini değerlendirmek ve bunları iyileştirmek için yapılacakları belirlemek kolay değildir. Ölçüm süreçlerinin yetenek ve olgunluğunu değerlendiren modeller bulunmaktadır, ancak bunlar sıklıkla CMMI ve SPICE gibi iyi tanımlanmış yetenek modellerini temel alarak ölçüm süreçlerine odaklanırlar. Çevik yöntemleri takip eden organizasyonların çoğu bu süreç odaklı olgunluk modellerini uygulamayı tercih etmiyor. Bu çalışma, organizasyonların kullandığı yazılım geliştirme yaklaşımından ve süreç mimarisinden bağımsız olarak, tekil ölçümleri inceleyerek yazılım organizasyonlarının ölçüm olgunluğunu değerlendiren bir yöntem sunmaktadır. Yöntem farklı bakış açıları için ölçümleri örneklemekte ve üç yetenek seviyesi için genel uygulamalar tanımlamaktadır. Organizasyonlar bu yöntemi ölçüm olgunluklarını anlamak ve iyileştirmek için kullanabilirler. Bu araştırma; modelin geliştirilmesi sırasında yürütülen eylem araştırması ve keşfedici vaka çalışmalarını, modelin uygulanması için yürütülen açıklayıcı vaka çalışmasını ve onun sonuçlarını içermektedir. Vaka çalışmaları yöntemin çevik yaklaşımlar kullanan organizasyonlara süreç odaklı yöntemlerle benzer sonuçlar sunmasına rağmen ek faydalar sunduğunu göstermiştir. Açıklayıcı vaka çalışmasının bulguları yöntemin sonuçlarının çalışmaya katılan küçük, orta ve büyük çaplı organizasyonların çalışanları tarafından kabul edildiğini ve faydalı bulunduğunu göstermiştir.

Bilişsel Bilimler EABD Doktora Programı öğrencisi Zeynep Başer, "ANA DİLİ TÜRKÇE OLAN TEK DİLLİ VE İNGİLİZCE ÖĞRENEN BİREYLERDE İLGİ TÜMCELERİNİN BAĞLANMASINDA SÖZDİZİMSEL HAZIRLAMA" konulu tezini, 24 Nisan 2018 tarihinde saat 10:00'da Konferans-1 salonunda savunacaktır.

Tez Özeti : Bu çalışmanın amacı ana dili Türkçe olan tek dilli ve İngilizce öğrenen bireylerde ilgi tümcelerinin isim tamlamalarında tamlayan ya da tamlanan ile bağlanmasında sözdizimsel hazırlama etkisini incelemektir. Sözdizimsel hazırlama, bir cümle en son karşılaşılan cümle ile aynı sözdizimsel biçime sahip olduğunda meydana gelen işlemlemenin kolaylaşmasıdır. Son otuz yılda pek çok çalışmada, bu olgu incelenmiştir. Ancak ana dili Türkçe olan tek dilli ve İngilizce öğrenen bireylerle sözdizimsel hazırlama çalışmaları oldukça azdır. Türkçe ve İngilizce tipolojik olarak farklı dil gruplarına aittir. Bu çalışma kapsamında her iki dilde ilgi tümcelerinin isim tamlamalarında tamlayan ya da tamlanana bağlanması ve yapısal hazırlama etkisi çalışılmış ve karşılaştırmalı olarak ana dil ve ikinci dilde anlam belirsizliklerinin çözülmesinde kullanılan stratejiler incelenmiştir. Gerekli veri çevrimdışı, çevrimiçi, ve göz izleme çalışmaları uygulanarak toplanmıştır. Veri analizi ana dili Türkçe olan tek dilli ve İngilizce öğrenen bireylerin kullandıkları çözümleme stratejileri ile ilgili önemli bulgular elde edilmesini sağlamıştır. İlgi tümcelerinde tamlayan ya da tamlanan tercihi üzerine etkisi bulunan pek çok etmen ortaya çıkmıştır. Bu çalışma şu etmenlerin rolüne dikkat çekmektedir: (i) tamlayan ve tamlanan isimlerde canlı / cansızlık bilgisi; (ii) tamlayan ve tamlanan isimler arasındaki anlamsal ilişki; (iii) tamlayan ve tamlanan isimlerin yüklemler ile anlamsal ilişkisi; (iv) ilgi tümcelerinde etken ya da edilgen fiil kullanımı. Ayıca, işleyen bellek kapasitesi ve ilgi tümcelerinin tamlayan ya da tamlanan ile bağlanması arasındaki ilişkiye değinilmiştir. Bunların dışında, yöntemsel etmenlerin, örneğin sunum şekli (örn. tüm cümle veya öbek öbek), teknik (örn. çevrimdışı,çevrimiçi, veya göz izleme çalışması), ve çalışma şartları (örn. örtülü işlemleme veya yönlendirilmiş değerlendirme; kavrama veya üretme), ilgi tümcelerinin bağlanması üzerine etkileri olduğu görülmüştür.

ODTÜ Lisansüstü Ödülleri Başvuruları

 TEZ ÖDÜLÜ 

 Tez Ödülü’nün amacı, tez konularının ülkemizin gelişimine, kültür ve düşün dünyasına katkıda bulunmasını sağlamak ve ülkemizin temel bilimde araştırma gücünü ODTÜ olarak artırmaktır.

 15 Eylül 2016 – 15 Eylül 2017 tarihleri arasında tez savunmasında başarılı bulunmuş olan tezler ödül için başvurabilir.

 Başvuru, tez sahibi/tez yöneticisi tarafından ilgili Enstitü’ye yapılır. Başvuru için gerekli belgeler: Tez Ödülü Başvuru Formu, bir adet tez kopyası, ve varsa tezden kaynaklanan yayınlar/bildiriler/patent belgesi.

  (Tez Ödülü Başvuru Formu, https://ii.metu.edu.tr/student-forms adresinden alınabilir.)

  Son başvuru tarihi: 06 Nisan 2018

DERS PERFORMANS ÖDÜLÜ

2018 yılında verilecek ders performans ödülü için Enstitüler kriterlere uygun öğrencileri belirleyecektir ayrıca başvuru yapmaya gerek yoktur.

Sağlık Bilişimi EABD Tıp Bilişimi Yüksek Lisans Programı öğrencisi Ahmet Levent Kandemir, "RESTING STATE BRAIN CONNECTIVITY VIA BICOHERENCE AND COHERENCE" konulu tezini, 

21 Mart 2018 tarihinde saat 14:00'da B-116 no.lu toplantı salonunda savunacaktır.

Tez Özeti : İkiz-uyumluluk, ikizgenin normalize halidir. İkizge, sinyal frekans bilgisinin üçüncü momenti olarak bilinir ve yüksek-dereceli izge kapsamında değerlendirilir. İkizge güç izgesi hakkında destekleyici bilgi sağlamaktadır ve sonar, biyomedikal mühendisliği, radar ve benzeri araştırma alanlarında etkili olduğu kanıtlanmıştır. Buna rağmen, çok boyutlu verileri işlemek için gerekli olan yoğun hesaplamalar ikizge diğer sinyal işleme metotlarından daha kullanışsız hale getirmektedir. Bu çalışma kapsamında ikiz-uyumluluğun bilgi içeriği değerlendirilecektir. Amaç, çok boyutlu ikiz-uyumluluk hesabına zaman kazandıran bir alternatif bulmaktır. Bulunan alternatiflerin sonuçları iyi bilinen uyumluluk analizi sonuçları ile karşılaştırılacaktır. Çalışma sırasında geliştirilen metotlar Human Brain Connectome Projesi kapsamında kaydedilen ve kullanıma açık Dinlenme Hali MEG verileri üzerinde uygulanacaktır.

Bilişsel Bilimler EABD Yüksek Lisans Programı öğrencisi Uğur Acar, "COGNITIVE ASPECTS OF BRAIN-COMPUTER COMMUNICATION: AN IMPLEMENTATION AND EXTENSION OF THE P300 SPELLER PARADIGM" konulu tezini, 

15 Mart 2018 tarihinde saat 09:00'da A-108 no.lu toplantı salonunda savunacaktır.

Tez Özeti : Beyin Bilgisayar Arayüzü (BBA) cihazları genellikle Elektroensefalografi(EEG) temelli beyin sinyalleri toplama teknikleri kullanmaktadır. Bu cihazları kullanarak araştırmacılar P300 olay bazlı potansiyellerinden yararlanarak beyin dalgaları ile ilgili deneyler ve BBA uygulamaları geliştirebilmektedirler. Çalışmada kullanılan model içerisinde üç farklı tip uyaran bulunmaktadır. Bu uyaran tipleri alfabenin harflerinden, temel ihtiyaçlar için sembollerden, ya da cümle oluşturmak için kelimelerden oluşmaktadır. Bu sayede kelime ve harf uyaranlarını kullanarak özne, yüklem ve nesneden oluşan cümleler kurulabilir. Teknik olarak, sunulan model öğrenme ve test olmak üzere iki kısımdan oluşmaktadır. Öğrenme safhasında kullanıcı alternatif uyaranlar arasından herhangi bir uyarana odaklanır ve sistem P300 uyaran bazlı elektrik potansiyelini algılayarak kullanıcının hangi uyarana odaklandığını tespit eder. Öğrenme safhası herbir kullanıcının sinirsel örüntülerinin anlaşılması için kullanılır. Bu sayede sistem kullanıcı bazlı öğrenme modelleri oluşturur. Öğrenme safhası bittikten sonra, kullanıcı sistemi iletişim amaçlı kullanabilir. Test safhalarında ise, kullanıcı iki farklı görevi yerini getirir. İlk görev, kelimeler, ikonlar veya harfleri kullanarak daha önceden belirlenmiş hedefleri gerçekleştirmesidir. İstenilen ile seçilen uyaranın farklı olması durumunda tutarsızlıktan dolayı N400 potansiyelinin oluşması beklenmektedir. N400 potansiyeli de istatiksel olarak analiz edilir. İkinci olarak, birşey içmeyi istemek, hissiyatını belirtmek gibi kullanıcılara aksiyon içeren görevler verilmektedir. Bu durumda kullanıcılar aksiyonları gerçekleştirirken üç farklı setten herhangi birini seçmede özgür bırakılır. Etkili bir iletişim için bu set seçimlerinin altında yatan bilişsel stratejiler analiz edilecektir. Özetle, önerilen tez beyin bilgisayar arayüz aletleri kullanılarak gerçekleştirilen beyin bilgisayar iletişiminin teknik ve bilişsel yönlerini biraraya getirmeyi hedefler.

Bilişim Sistemleri EABD Yüksek Lisans Programı öğrencisi Murat Vural, "FNIR SENSÖRLER İLE PİLOT İŞ YÜKÜNÜN ÇEVRİMİÇİ TESBİTİ." konulu tezini, 14 Mart 2018 tarihinde saat 16:30'da A-212 no.lu toplantı salonunda savunacaktır.

Tez Özeti : Havacılık gibi emniyet tedbirlerinin kritik olduğu bir alanda, pilotların mental iş yükünün doğru bir şekilde ölçülüp yorumlanması operasyonun güvenli bir şekilde tamamlanmasında kullanılacak önemli bir metottur. Ancak doğru ölçümleri çevrim içi olarak pilotun uçuş kabiliyetlerini sınırlandırmadan yapabilmek insan faktörü ve havacılık psikolojisi açısından üzerinde çalışılan aktif bir çalışma alanı haline gelmiştir. Bu tez çalışmasında pilotların mental iş yükünün simülasyon ortamında ve çevrim içi olarak ölçülmesi ve bu ölçümlerin kullanılarak gerekli tedbirlerin alınmasına vesile olacak çalışmalara zemin hazırlanması hedeflenmektedir. fNIR (Functional Near Infrared Spectroscopy) teknolojisinin insanlı uygulamalardaki başarısı ve sensörlerinin diğer beyin görüntüleme yöntemlerine göre pilotu rahatsız etmeyecek daha ergonomik yapısı nedeniyle ölçümlerin fNIR sensör ve kontrol üniteleri ile yapılması ön görülmektedir. İyi tanımlanmış çeşitli test senaryoları ile önce çevrim dışı olarak ölçümlerin yapılıp algoritmaların üretilmesi, daha sonra da bu algoritmaları kullanarak çevrim içi sonuçlar üretecek bir yazılım geliştirilmesi planlanmaktadır.