Enformatik Enstitüsü

Aşağıdaki alanlarda 100/2000 YÖK Doktora Bursu verilecektir.
2018-2019 Güz dönemi için YÖK 100/2000 Doktora bursu başvurusunda bulunmak isteyen adayların evraklarını Enformatik Enstitüsü Öğrenci İşlerine en geç 10 Eylül 2018 saat 12:00’ye kadar elden teslim etmesi gereklidir.

Burs başvurusu için gerekli koşullar: http://www.yok.gov.tr/web/100-2000/ana-sayfa


Başvuru için gerekli evraklar:
1. Transkript (Lisans ve Yüksek Lisans)
2. Lisansüstü sınav sonucu (ALES)
3. Dil sınav sonucu (UDS/YDS/TOEFL)
4. Burs programına başvurmak istediğine dair başvurmak istediği alanı ve EABD’nı, doktora eğitimindeki durumunu, çalışıp çalışmadığını, kimlik ve iletişim bilgilerini içeren
(adres, telefon numarası, e-posta) dilekçe

Alanlar:                                                           

• Veri Bilimi (Büyük Veri, Veri Madenciliği, Veri Depolama ve Veri Analitiği, Örüntü Tanıma)
• Biyoenformatik ve Biyoistatistik

Veri Bilimi (Büyük Veri, Veri Madenciliği, Veri Depolama ve Veri Analitiği, Örüntü Tanıma): Bilişim Sistemleri (EE), Sağlık Bilişimi (EE), Bilişsel Bilimler (EE), İstatistik (FBE), Bilimsel Hesaplama (UME), Finansal Matematik (UME), Kriptografi (UME), DBE öğrencilerine öncelik verilecektir.

Biyoenformatik ve Biyoistatistik alanı için: Sağlık Bilişimi (EE), Bilgisayar Mühendisliği (FBE), Biyolojik Bilimler (FBE), İstatistik (FBE), DBE öğrencilerine öncelik verilecektir.





Ayrıntılı Bilgi İçin:     0312 210 37  43  -  0312 210 37 40

Siber Güvenlik EABD Yüksek Lisans Programı öğrencisi Rauf Kaan Denizer, "KULLANICI PAROLALARINDAKİ DİL BİLGİSEL ÖRÜNTÜLERİN ARAŞTIRILMASI: OLASILIKSAL İÇERİKTEN BAĞIMSIZ DİL YAKLAŞIMI" konulu tezini, 03 Eylül 2018 tarihinde saat 13:00'da A-108 no.lu toplantı salonunda savunacaktır.

Tez Özeti : Web siteleri ve uygulamalar çoğunlukla hesap adı ve parola kullanan kimlik doğrulama yöntemleri uygulamaktadırlar. Yakın tarihli bir araştırmaya göre, Amerika Birleşik Devletlerinde bir e-posta adresi, ortalama 130 farklı kullanıcı hesabı ile ilişkili durumdadır. Çok sayıda kullanıcı hesabı ve parolaya sahip olmak, kullanıcıları aynı parolanın sonuna sayı eklemek gibi çok bilinen kalıplara sahip ve kolay tahmin edilebilir parolalar üretmeye zorlamaktadır. Parola güvenliği için daha karmaşık ve maliyetli korucuyu tekniklerin geliştirilmesi, saldırganları kaba kuvvet saldırıları yerine parola tahmin etme yöntemleri geliştirmeye yönlendirmektedir. Son zamanlarda yapılan çalışmalar çoğunlukla ana dili İngilizce olan kullanıcıların parolalarının analizlerini içermektedir. Öte yandan, farklı dilleri konuşan kullanıcılar parola oluştururken farklı örüntüler sergileyebilirler. Bu tez, ana dili Türkçe olan kullanıcıların oluşturduğu parolalardaki dil bilgisel örüntüler üzerine odaklanmaktadır. Bulgularımızla beraber olasılıksal içerikten bağımsız dil kullanarak oluşturduğumuz çerçeve ve değerlendirmesi sunulmuştur.

Sağlık Bilişimi EABD Biyoenformatik Yüksek Lisans Programı öğrencisi Alperen Taciroğlu, "ODYSSEY: MİKRORNA - GEN EKSPRESYONUNUN ETKİLEŞİMLİ AĞLAR OLARAK GÖRSELLEŞTİRİLMESİ ÜZERİNE BIR YAZILIM" konulu tezini, 03 Eylül 2018 tarihinde saat 14:00'da A-212 no.lu toplantı salonunda savunacaktır.

Tez Özeti : MikroRNA’lar kodlamayan RNA moleküllerinden olup simdiye kadar çalısılmıs bütün omurgasız hayvanlar dahil pek çok organizmada islevsel roller alırlar. Farklı omurgasız türleri göz önüne alındıgında, 200’e kadar farklı gen, mikroRNA kodlamasında görev alabilir. Ilk olarak 20 yıl önceki kesiflerinden bu yana, hücre içerisindeki görevleri, hangi biyolojik yolaklarda regülatör olarak görevler aldıkları çok çesitli arastırmalara konu olmustur. Bu arastırmalar sonucunda, apoptoz, homeostaz, gelisimsel biyoloji, kanser olusumu ve virus enfeksiyonları sonucu aktive olan yolaklar dahil farklı birden çok önemli biyolojik mekanizmalarda etken rol aldıkları gözlemlenmistir. MikroRNA’lar bu mekanizmalara genel olarak post-transkripsiyonel asamada mesajcı RNA moleküllerine baglanıp, bu moleküllerin stabilitesini bozarak yön verirler. Evrimsel süreçte incelendiklerinde, nükleotit dizilimlerinin korunmus oldugu fark edilmistir ve bu da hücre içerisindeki görevlerinin önemini vurgular niteliktedir. ’Odyssey’ mikroRNA’ların baglandıkları genlerle olan iliskilerini etkilesimli aglar yoluyla çizmek için R programlama dilinin Shiny paketi kullanılarak gelistirildi. Bu web uygulaması gelistirilirken, kullanıcıların kendi biyolojik ekspresyon datasını yükleyebilecekleri ve bu data üzerinden karsılastırmalı ekspresyon analizi yapabilecekleri, ayrıca bu analiz sonucunda çıkan sonuçları etkilesimli ag olarak çizebilecekleri kullanımı kolay bir arayüze sahip olmasına özen gösterildi. Ayrıca Odyssey’de bu agları olusturan mikroRNA veya genlerin ekspresyon analizi sonucunda çıkan degerler üzerinden filtrelenebilmesi için modüller eklendi. Web uygulamasının nihai amacı olarak kullanıcının analizini yaptıgı data fenotipini açıklayıcı nitelikte güçlü bir öngörü aracı olarak kullanılabilmesi hedeflendi.

Bilişsel Bilimler EABD Yüksek Lisans Programı öğrencisi Mani Tajaddini, "EYE-TRACKİNG TEKNOLOJİSİYLE RİSKLİ KOŞULLARDA KARAR VERMEK ÜZERİNDE GRUP ETKİSİ İNCELEME" konulu tezini, 28 Ağustos 2018 tarihinde saat 10:00'da A-108 no.lu toplantı salonunda savunacaktır.

Bilişsel Bilimler EABD Yüksek Lisans Programı öğrencisi Efecan Yılmaz, "SANAL GERÇEKLİK ORTAMINDA YÖNLENDİRİCİ BAKIŞLAR" konulu tezini, 28 Ağustos 2018 tarihinde saat 11:30'da A-108 no.lu toplantı salonunda savunacaktır.

Tez Özeti : İnsan-robot etkileşimi araştırmaları muhattapların ortak eylem durumlarındaki işbirliği, insan-robot etkileşiminde gösterim özellikleri veya ortak etkileşim ortamlarının özellikleri gibi konular içerir. Özellikle yönlendirme ifadeleri ortak eylem durumlarında hem ifade üretimi ve ifade çözümlemesi bakış açılarından çalışılmaktadır. Bunların yanında, insan-robot etkileşiminde bakışsal etkileşimlerdeki görsel dikkatte seçicilik ve göze çarpma örnekleri de bazı diğer aktif araştırma alanları arasındadır. Bu tezde insan-robot etkileşiminde ve ortak eylem durumlarında, sanal-gerçeklik ortamında göz takip teknolojisinden de destek alarak, sözel olmayan iletişimin arttırılmasını araştırılmıştır. Bu amaçla, deneylerimizde çok kipli bir yaklaşımla sözel olmayan ifadeler ve sözel referanslar ile çoklu robot ajan, tek insan deney ortamı kullanılmıştır. Ayrıca, katılımcıların gösterim çözümleme zamanlarını ve doğruluklarını, ek olarak da bakış ile etkileşimlerini değerlendirirken, robot ajanlarının tasarımında bir etkileşim etkisini araştırmak için iki ayrı robot ajan tasarımı kullanılmıştır.

Bilişim Sistemleri EABD Yüksek Lisans Programı öğrencisi Alper Sarıkaya, "TOPLULUK SINIFLANDIRICISIYLA ANOMALİ TABANLI SİBER İHLAL TESPİT SİSTEMİ" konulu tezini, 06 Eylül 2018 tarihinde saat 14:00'da A-212 no.lu toplantı salonunda savunacaktır.

Tez Özeti : Günümüzde siber saldırılar gittikçe artan sıklıkta oluşmaya başlamıştır. Bununla birlikte saldırıların çeşitliliği, boyutu ve yoğunluğu da buna paralel olarak artmaktadır. Güvenlik cihazlarındaki loglar incelendiğinde, saldırılara ait verilerinin büyük miktarlarda oluştuğu görülmektedir. Bununla birlikte, logların insan tarafından doğru bir şekilde değerlendirilmesi de zorlaşmaktadır. Dolayısıyla bu çok büyük veri setinden saldırıyı ayırt etmek için kullanılabilecek temel verilerin tespiti hem saldırının hızlı bir şekilde tespit edilmesi hem de güvenlik cihazlarının hızlı tepki verebilmesi için önem taşımaktadır. Bu çalışmada makine öğrenimi ile veri setinden uygun verilerin seçilmesini ve bu verilerin seçiminde saldırıya özgü ayırt edici niteliklerin tespitine yönelik çalışma yapılacaktır. Sonuç olarak bu çalışmada siber saldırı tespitinde kullanılacak verilerin seçilmesini araştıracağız.

Enformatik Enstitüsü Sağlık Bilişimi ABD öğretim üyesi Doç. Dr. Nurcan Tunçbağ, 2018 yılı UNESCO-L'Oréal Ulusal Genç Bilim Kadınlarına Destek Bursu'nu kazandı.

İlgili video için lütfen tıklayınız.

Bilişim Sistemleri EABD Doktora Programı öğrencisi Betül Aygün, "TALEP ÜZERİNE VİDEO (VOD) UYGULAMALARI İÇİN KAMU BULUT KAYNAKLARI TAHSİS SİSTEMİNİN MATEMATİKSEL MODELLEME ÇÖZÜMÜ İÇİN İKİLİ PSO TEKNİĞİNİN UYGULANMASI" konulu tezini, 03 Eylül 2018 tarihinde saat 14:00'da Konferans Salonu-1 toplantı salonunda savunacaktır.

Tez Özeti : İsteğe bağlı ya da gerçek zamanlı video akışı hizmetleri, son zamanlarda kullanılan en popüler hizmetlerden biri haline gelmiştir. Ancak, çoklu ortam verilerinin video tipinin, diğer multimedya veri türlerinden daha fazla gerçek zamanlı depolama ve yüksek veri aktarımına ihtiyaç duyması nedeniyle bu tür uygulamalar için yapılan yatırımlar çok ciddi finansal soruna neden olmaktadır. Ayrıca, videoları servis edebilmek için önemli miktarda sistem kaynağına da ihtiyaç duyulmaktadır. Bu sorunu çözmek için bulut bilişim tercih edilen bir teknoloji olarak ortaya çıkmaktadır. Bulut hizmetleri organizasyonları, kuruluşların donanım veya yazılıma yatırım yapmadan hizmet sunmalarını sağladıkça gittikçe daha karmaşık hale gelmektedir. Çok sayıda bulut servis sağlayıcıları, çeşitli bölgelerde çeşitli uygulamalar için farklı fiyatlandırma sunmaktadır. Bu sebeple, gelen hizmet taleplerinin, minimum maliyet ve maksimum kullanıcı memnuniyeti (QoS) ile uygun bulut hizmetlerine tahsis edilmesi büyük önem taşımaktadır. Birden fazla bulut sağlayıcı, farklı hizmet kalitesi gereksinimleri, farklı hizmet seviyesi anlaşmaları (SLA) ve talep belirsizliği, fiyat ve kullanılabilirlik, kaynak tahsisinin optimizasyonu gibi konulardan dolayı bazı zorluklar vardır. Bu çalışmanın amacı, kullanıcıların QoS gereksinimlerine bağlı olarak bulut CDNleri, depolama ve kod dönüştürücülerini kullanarak talep üzerine video hizmetlerinin maliyetini ve performansını optimize etmektir. Bu makalede, Karma Tamsayı Kuadratik Programlama ve Parçacık Sürü Optimizasyonu (PSO) algoritmasının farklı çeşitleri, bulut kaynaklarına video isteklerini atamak için kullanılmaktadır. Problemin doğası gereği sürekli PSO kullanmak mümkün değildir, ancak İkili PSO ile bulgusal algoritmaları birleştiren yeni algoritmalar önerilmektedir. Bu algoritmaların sonuçları, en iyi sonucu veren MIQP ile karşılaştırılmaktadır. Sonuçlar, önerilen algoritmaların diğer algoritmalarından daha iyi sonuçlar verdiğini göstermektedir.

Sağlık Bilişimi EABD Biyoenformatik Yüksek Lisans Programı öğrencisi Tuğba Kaya, "GLİOBLASTOMADA HASTAYA ÖZGÜ MUTASYONLARIN YAPISAL HARİTALANMASI VE AĞ ANALİZİ" konulu tezini, 27 Ağustos 2018 tarihinde saat 14:00'da A-212 no.lu toplantı salonunda savunacaktır.

Tez Özeti :Kanser dünya çapında en yaygın ölüm nedenlerinden biridir. Bu nedenle, farklı tipteki tümörlerin mutasyon profillerinin çıkarılmasına çokça çaba harcanmıştır; örneğin, Kanser Genom Atlas (TCGA) 11000den fazla tümör örneği için omik veri biriktiren platformlardan biridir. Bu tezde, TCGAden Glioblastoma için hastaya özgü mutasyon verilerini alan, Protein Databank (PDB)den elde edilen protein yapıları üzerine haritalayan, yerini ve fonksiyonel etkisini tespit eden ve protein interaktomu ile entegre ederek fonksiyonel ağları yeniden yapılandıran bir veri işleme hattı sunmaktayız. Bu tez sonucunda, bazı mutasyonların, proteinin bilinen dizisi yerine alternatif izoform dizisine spesifik olduğunu bulduk. Aynı zamanda, etkileşim yüzeyindeki mutasyonların fonksiyonel etkisinin iç bölgesindeki etkilere benzer olduğunu ve yüzey bölgesi ile karşılaştırıldığında daha çok zarar verdiğini gösterdik. Protein iç kısmındaki en yaygın değişimin, hidrofobik amino asitlerin başka bir hidrofobik amino aside değişiminin olduğunu gösterdik. Bununla birlikte, yüzey veya etkileşim yüzeyinde, mutasyonların kimyasal sınıflarını analiz ettiğimizde yüklü bir amino asit başka bir yüklü ya da polar amino aside dönüşmüştür. TCGAdeki hastaların bu mutasyon profillerinden, prize collecting Steiner forest (PCSF) problemini çözen ve verilen bir protein kümesini bir ağ bağlamında en iyi şekilde birleştiren Omics Integrator ile GBMda hastaya özgü 290 tane ağı yeniden oluşturduk. Bu hastalar arasında en yaygın protein düğümleri ve ayrıtlarını birleştirdik ve bu birleştirilmiş ağı işlevsel topluluklar halinde kümeledik. Ontoloji ve yolak analizleri Wnt sinyal ERBB sinyal ve NfKb / Ikb sinyal yolaklarının en yaygın zenginleştirilmiş yolaklar olduğunu göstermiştir. Mutasyondan protein yapılarına ve fonksiyonel ağlara kadar, bu tez çalışmasının sonucunun kanser araştırmalarına önemli katkı sağlayacağına inanıyoruz.

Bilişim Sistemleri EABD Yüksek Lisans Programı öğrencisi Ayşe Begüm Kılıç, "YUMUŞAK SİSTEMLER METODOLOJİSİNİ KULLANARAK TEDARİK ZİNCİRLERİNİN DİJİTAL TEDARİK ZİNCİRLERİNE DÖNÜŞTÜRÜLMESİNİ İNCELEME VE BİR VAKA ÇALIŞMASI" konulu tezini, 04 Eylül 2018 tarihinde saat 13:30'da A-212 no.lu toplantı salonunda savunacaktır.

Tez Özeti : Günümüzde Endüstri 4.0 popüler bir konu haline gelmiştir. Endüstri 4.0 temel olarak firmalara ileri teknoloji kullanarak daha yüksek kâr sağlamayı amaçlamaktadır. Ancak bu hedefe ulaşabilmek için tüm şirket operasyonlarının dijital ortama geçişinin sağlanması oldukça önemlidir. Bu sebeple gerçek ortamdan sanal ortama geçişin incelenmesi gelecek açısından büyük önem taşımaktadır. Bu tez Yumuşak Sistemler Metodolojisi (YSM) kullanarak, firma bazında, günümüz tedarik zincirlenin dijital tedarik zincirine dönüşmesini incelemeyi amaçlamaktadır. YSM araştırmacıların problemleri tanımlamalarını ve analiz etmelerini mümkün kılmaktadır. Problemlerin gerçek sebeplerini ortaya çıkararak çözmek için gerekli önerilerde bulunmalarını sağlamaktadır. YSM sayısal veri gerektirmemektedir ve açıkça tanımlanamayan, belirsiz problemler üzerinde çalışmak için uygundur. Sıradan tedarik zincirlerinden dijital tedarik zincirlerine geçiş sayısal olarak belirtilemediği ve değişim ortamı kolayca tanımlanamadığından YSM uygulanmaya karar verilmiştir. Tezin içeriğinde bir firmaya uygulanacak olan örnek olay incelenmesi bulunacaktır. İnceleme, görüşme tekniği ile yürütülecektir ve YSM bu görüşmelerden elde edilecek öznel verilerin incelenmesine olanak sağlayacaktır. Tez sonunda geçişin gerçek hayatta nasıl gerçekleşebileceğinin tanımlanması ve firmalar için değişimle başa çıkma yollarına dair önerilerde bulunulması beklenmektedir.