Proteinlerin nasıl çalıştığını anlamak için önemli olan allosterik protein düzenlemesini incelemek için yeni bir yöntem geliştirildi. Yöntem, proteinleri ağlar olarak temsil eder ve allosterik bölgelerin varlığını ve yerini tahmin etmek için moleküllerin bağlandığı ve protein aktivitesini düzenlediği allosterik yolları veya bölgeleri tanımlar. Bu yöntem potansiyel olarak hedefe yönelik tedavilerin geliştirilmesine yardımcı olabilir.

Tarih: 18.01.2023 / 10:00 Yer: A212

Yazılım endüstrisi tüm dünya ekonomilerinin gelişiminde önemli bir rol oynamaktadır. Bu firmaların çoğunluğu küçük ve orta ölçekli şirketlerden (KOBİ) oluşmaktadır. Bu şirketler ürün kalitesini ve verimliliğini artırmak için Yazılım Süreç İyileştirmelerinden (YSİ) faydalanmayı amaçlamaktadır. YSİ uygulamaları beraberinde kurumsal değişim ve yeni iş uygulamalarına adapte olmayı gerektirdiğinden; kurumlar değişimden kaynaklanan çeşitli zorluklarla başa çıkmak zorundadır. Bu çalışmanın amacı, KOBİ’lerde kullanılan YSİ modellerinin başarısını ve kabulünü etkileyen faktörleri belirlemektir. Ayrıca Türkiye'deki KOBİ çalışanlarının YSİ modellerine yönelik tutumlarının analiz edilmesi amaçlanmaktadır.

Tarih: 25.01.2023 / 14:00 Yer: B-116

Yeni Nesil Dizileme teknolojisi ile elde edilen mikrobiyom verilerinin istatistiksel analizi, verilerin gerçek uzayda olduğu varsayılarak yapılır. 2017 yılından itibaren mikrobiyom veri analizlerinin reel uzayın bir alt uzayı olan simplex üzerinde yapılması gerektiği tartışılmaktadır. Çünkü mikrobiyom verileri "bileşimsel"dir. Bu tezde mikrobiyom verilerinin özellikleri ve mikrobiyom analizinin istatistiksel zorlukları incelenmiştir. Daha sonra, mikrobiyom verilerinin filogenetik gruplamasına bir alternatif olan verilerin bileşimsel doğası kullanılarak yeni bir gruplama yöntemi (Temel Mikrobiyal Gruplar) tanıtılmıştır.

Tarih: 18.11.2022 / 11:30 Yer: A212

Derin öğrenmede, küçük kaymalar veya döndürmeler çıktıda dramatik değişikliklere neden olabilir. Bunun nedeni, max pooling, strided convolution ve average pooling gibi yaygın olarak kullanılan down-sampling tekniklerinin örnekleme teoremini dikkate almamasıdır. Döngülü-Çevirim (DÇ) sinyal işleme tekniğinin derin öğrenmede, ekstra öğrenilebilir parametreler eklemeden doğruluğu artırmak için down-sampling aşamasından önce kullanılabileceğini gösterdik. Önerilen yöntem GAN, sınıflandırma ve nesne algılama gibi farklı algoritmalara uygulanabilir.

Tarih: 29.11.2022 / 13:00 Yer: ODTÜ Enformatik Enstitüsü 

Cerrahi planlama ve hasta yönetimi bakımından gelecekte AAA büyüme oranını tahmin edebilir bir araç geliştirmek önemlidir. Bu çalışmada, 25 Kore'li hastaya ait 106 BT görüntüsü geçmişe dönük elde edilmiştir. Görüntülerden elde edilen 21 geometrik hesaplama, bunların büyüme oranları, ikili korelasyonları analiz edilmiş ve yüksek riskli anevrizmalar için büyümenin tahmin edilmesi iyileştirmeye çalışılmıştır. Ayrıca, hastanın karakteristiğine özgü çeşitli geometrik ölçümler kullanılarak geliştirilen tahminleme modeli herhangi bir zaman noktasında güven aralığı sağlayarak tahminleme yeteneğini geliştirmiştir.

Tarih: 02.03.2020 / 12:40 Yer: Konferans Salonu-1

Bu tez çalışmasında, NFC uyumlu mobil cihazların kullanıldığı relay saldırılarını önleyen, rol tabanlı yetki erişim sistemi temeli üzerinde kurgulanmış bağlama duyarlı bir güvenlik modeli önerilmektedir. Bu çalışma kapsamında, muhtemel güvenlik açıkları ve gereksinimler tanımlanmış daha sonra model tasarlanmıştır. Konseptsel tasarımın yanı sıra, modelin üzerinde uygulandığı bütüncül bir test ortamı geliştirilmiştir. Son olarak ise modeli hem teorik olarak hem de pratik olarak doğrulamaktayız.

Tarih: 27.01.2020 / 16:00 Yer: Konferans Salonu-1

Fenoloji vektörleri arasındaki açısal mesafeye göre bükme gerçekleştiren vektör dinamik zaman bükme algoritması geliştirilmiştir. Testler, önerilen VDTW yönteminin farklı tarım uygulamalarını, iklim ve atmosferik etkileri ve yıllar arasındaki ölçüm hatalarını telafi eden zamansal ve spektral değişimlere karşı gürbüz olduğunu göstermektedir. Ayrıca, sınırlı veri ile yüksek sınıflandırma doğruluklarına izin veren optimal zaman penceresini belirlemek için bir yöntem de geliştirilmiştir. Testlerde, 2013-2015 yılları arasında Harran Ovası’nda pamuk ve mısır, Bismil Ovası’nda mısır, pamuk ve soya fasülyesi ürünlerini içeren zaman serisi Landsat 8 uydu görüntüleri kullanılmıştır. Bunun yanında, 2017 ve 2018 yıllarında ABD, Kansas'taki VDTW mısır ve soya fasulyesini Harmonize Landsat Sentinel (HLS) verileriyle testler gerçekleştirildi.

Tarih: 15.01.2020 / 14:00 Yer: Konferans Salonu-1

Face-to-face conversation implies that interaction should be characterized as an inherently multimodal phenomenon involving both verbal and nonverbal signals. Gaze is a nonverbal cue that plays a key role in achieving social goals during the course of conversation. The purpose of this study is twofold: (i)to examine gaze behavior (i.e., aversion and gaze on face) and relations between gaze and speech in face to face interaction, (ii)to construct computational models to predict gaze behavior using high-level speech features.

Tarih: 13.01.2020 / 10:30 Yer: Konferans Salonu-1

Bu çalışmada, işlevsel beyin görüntülemesi (iMRG) ile elde edilen veriden zihinsel durumların çözümlenmesi için bir beyin modeli sunuyoruz. Varsayımlarımız, insan beyinin duyu organlarından gelen bilgileri özelleşmiş beyin bölgelerinde işliyor oluşu ile bu özelleşmiş beyin bölgelerinin aktivitesini kullanarak bağdaşık bir zihinsel durumu oluşturuyor olmasıdır. Bu varsayımlardaki bilgi işleme örüntüsünden yola çıkan bir beyin modelini oluştururken: İlk olarak, özelleşmiş beyin bölgelerindeki aktiviteyi elde etmek için süpervoksel olarak adlandırdığımız homojen voksel (hacimli piksel) gruplarını kullanıyoruz. İkinci olarak, genel zihinsel durumu çözümlemek için süpervoksellerin aktivitelerini Beyin Bölgesi Toplulukları (BBT) olarak adlandırdığımız sınıflandırıcı toplulukları ile birleştiriyoruz.

Modelimiz, denediğimiz üç farklı iMRG veri kümesinde, yaygın olarak kullanılmakta olan ve voksel seçimine dayanan beyin çözümlemesi yöntemlerinden zihinsel durumların sınıflandırılmasının doğruluğu bakımından daha yüksek başarım göstermektedir. Bunun yanında, süpervoxellerin fMRI deneylerine ilişkin zihinsel durumları birbirinden ayırmada etkin bölgeleri belirlemek için nasıl kullanılabileceğini de gösteriyoruz.

Tarih: 07.10.2019 14:30 Yer: Konferans Salonu 1

Tıbbi ultrasonografi, bazı önemli klinik avantajlara sahiptir. Görüntü kalitesinde artış, klinik kullanımda fayda sağlayacaktır. Bu tez kapsamında, B-mod ultrasonografi görüntülerinde görüntü kalitesi artırımı ve benek örütüsünün azaltılması hedeflenmiştir. Bu amaçla, hem tek hem de kesit-içi, serbest-elle toplanan çoklu 2B, B-mod ultrason görüntüleri kullanılmıştır. Katı olmayan görüntü çakıştırma ve tek-görüntülü Bayesçi onarma ve çok-görüntülü çözünürlük-üstü onarma yöntemleri, benek örüntüsü üzerine detaylı istatistiksel bir çalışma ile birleştirilmiştir. Önerilen yöntemler, literatürdeki yaygın görüntü onarma ve filtreleme yöntemleri ile kıyaslanmıştır. İyileşme miktarının değerlendirilmesinde, konu bağlamına uygun nesnel ölçütler kullanılmıştır. Buna ek olarak, uzman görüşlerinin değerlendirilmesinde görsel puanlama çözümlemesi uygulanmıştır.

Tarih: 24.07.2019 Yer: Konferans 1 Salonu