PhD Thesis

Ph.D. Thesis

Ayhan Serkan Şık, Türkiye’deki Genetik Bilgi Değişimi Kodlama Standartları için Kavramsal Bir Tasarım

Türkiye'de, kapsamlı ve birincil sağlık harcamaları, Genel Sağlık Sigortası kapsamında Sosyal Güvenlik Kurumu tarafından sağlanmaktadır. 2003 yılında Sağlık Bakanlığı, “Sağlıkta Dönüşüm Programı”nı başlatmış ve birlikte çalışabilir sağlık veri alışverişi standartlarını uygulamaya koymuştur. Sağlık Bakanlığı, tüm sağlık hizmeti sağlayıcılarında oluşturulan tıbbi verilerin kodlanmış, yapılandırılmış ve elektronik biçimde toplanmasına odaklanmaktadır. Bunun aksine, genetik test sonuçları devlet ve özel sağlık hizmeti sağlayıcıları arasında metinsel ve yapılandırılmamış bir biçimde paylaşılmaktadır. Bu tezde, genetik veri takaslamasındaki darboğazları sunarak, Türkiye Elektronik Sağlık Kayıtları için anlamlı genomik veri alışverişi amacıyla kavramsal bir model ortaya koyuyoruz.

Tarih: 18.01.2023 / 15:00 Yer: B-116

Turkish

Mehmet Ali Arabacı, Karar Tümleştirme Yoluyla Çok-Kipli Birinci Şahıs Hareket Tanıma

Birinci şahıs hareket tanıma için farklı sensörlerden (örneğin optik, ses, ivmeölçer) gelen bilgilerin füzyonu hala aktif bir araştırma alanıdır. Sensör çeşitliliğindeki artış adaptif füzyona olan ihtiyacı ortaya çıkarsa da bu konuda sınırlı sayıda çalışma bulunmaktadır. Bu çalışmada, birinci şahıs hareket tanıma için iki yeni çok kipli karar tümleştirme çatısı önerilmiştir. İlkinde, üretilen öznitelikler Çoklu Kernel Öğrenmesi kullanılarak birleştirilmektedir. Diğerinde ise derin öznitelikler için iki aşamalı karar tümleştirme mekanizması kullanılmaktadır. Ek olarak, 30 farklı birinci şahıs hareketi ve 1392 video kayıt parçası içeren Egocentric Outdoor Activity Dataset (EOAD) isimli yeni bir birinci şahıs hareket veri seti oluşturulmuştur.

Tarih: 18.01.2023 / 14:00 Yer: A108

Turkish

Melike Çağlayan, Kalıntı- Kalıntı Ağlar ile Proteinlerdeki Allosterik Düzenlemeler

Proteinlerin nasıl çalıştığını anlamak için önemli olan allosterik protein düzenlemesini incelemek için yeni bir yöntem geliştirildi. Yöntem, proteinleri ağlar olarak temsil eder ve allosterik bölgelerin varlığını ve yerini tahmin etmek için moleküllerin bağlandığı ve protein aktivitesini düzenlediği allosterik yolları veya bölgeleri tanımlar. Bu yöntem potansiyel olarak hedefe yönelik tedavilerin geliştirilmesine yardımcı olabilir.

Tarih: 18.01.2023 / 10:00 Yer: A212

Turkish

Suna Durmuş, Yazılım Süreç İyileştirme Modellerinin Küçük ve Orta Ölçekli Şirketlerde Kabulü: Türkiye’de Bilişim Sektörünün Ampirik Bulguları

Yazılım endüstrisi tüm dünya ekonomilerinin gelişiminde önemli bir rol oynamaktadır. Bu firmaların çoğunluğu küçük ve orta ölçekli şirketlerden (KOBİ) oluşmaktadır. Bu şirketler ürün kalitesini ve verimliliğini artırmak için Yazılım Süreç İyileştirmelerinden (YSİ) faydalanmayı amaçlamaktadır. YSİ uygulamaları beraberinde kurumsal değişim ve yeni iş uygulamalarına adapte olmayı gerektirdiğinden; kurumlar değişimden kaynaklanan çeşitli zorluklarla başa çıkmak zorundadır. Bu çalışmanın amacı, KOBİ’lerde kullanılan YSİ modellerinin başarısını ve kabulünü etkileyen faktörleri belirlemektir. Ayrıca Türkiye'deki KOBİ çalışanlarının YSİ modellerine yönelik tutumlarının analiz edilmesi amaçlanmaktadır.

Tarih: 25.01.2023 / 14:00 Yer: B-116

Turkish

Aslı Boyraz, Bileşimsel Veri Yaklaşımı Kullanarak Mikrobiyom Veri Analizi

Yeni Nesil Dizileme teknolojisi ile elde edilen mikrobiyom verilerinin istatistiksel analizi, verilerin gerçek uzayda olduğu varsayılarak yapılır. 2017 yılından itibaren mikrobiyom veri analizlerinin reel uzayın bir alt uzayı olan simplex üzerinde yapılması gerektiği tartışılmaktadır. Çünkü mikrobiyom verileri "bileşimsel"dir. Bu tezde mikrobiyom verilerinin özellikleri ve mikrobiyom analizinin istatistiksel zorlukları incelenmiştir. Daha sonra, mikrobiyom verilerinin filogenetik gruplamasına bir alternatif olan verilerin bileşimsel doğası kullanılarak yeni bir gruplama yöntemi (Temel Mikrobiyal Gruplar) tanıtılmıştır.

Tarih: 18.11.2022 / 11:30 Yer: A212

Turkish

Ülkü Uzun, Derin Ögrenmede Döngülü Çevirim Yönteminin Kullanımı

Derin öğrenmede, küçük kaymalar veya döndürmeler çıktıda dramatik değişikliklere neden olabilir. Bunun nedeni, max pooling, strided convolution ve average pooling gibi yaygın olarak kullanılan down-sampling tekniklerinin örnekleme teoremini dikkate almamasıdır. Döngülü-Çevirim (DÇ) sinyal işleme tekniğinin derin öğrenmede, ekstra öğrenilebilir parametreler eklemeden doğruluğu artırmak için down-sampling aşamasından önce kullanılabileceğini gösterdik. Önerilen yöntem GAN, sınıflandırma ve nesne algılama gibi farklı algoritmalara uygulanabilir.

 

Tarih: 29.11.2022 / 13:00 Yer: ODTÜ Enformatik Enstitüsü 

Turkish

Emrah Akkoyun, Abdominal Aort Anevrizmalarında Boylamsal Veri Kullanarak Büyümenin Modellenmesi

Cerrahi planlama ve hasta yönetimi bakımından gelecekte AAA büyüme oranını tahmin edebilir bir araç geliştirmek önemlidir. Bu çalışmada, 25 Kore'li hastaya ait 106 BT görüntüsü geçmişe dönük elde edilmiştir. Görüntülerden elde edilen 21 geometrik hesaplama, bunların büyüme oranları, ikili korelasyonları analiz edilmiş ve yüksek riskli anevrizmalar için büyümenin tahmin edilmesi iyileştirmeye çalışılmıştır. Ayrıca, hastanın karakteristiğine özgü çeşitli geometrik ölçümler kullanılarak geliştirilen tahminleme modeli herhangi bir zaman noktasında güven aralığı sağlayarak tahminleme yeteneğini geliştirmiştir.

Tarih: 02.03.2020 / 12:40 Yer: Konferans Salonu-1

Turkish

Davut Çavdar, Nfc Özellikli Mobil Cihazların Kullanıldığı Relay Saldırılarını Önleyen Bağlama Duyarlı Bir Güvenlik Modelinin Tasarımı

Bu tez çalışmasında, NFC uyumlu mobil cihazların kullanıldığı relay saldırılarını önleyen, rol tabanlı yetki erişim sistemi temeli üzerinde kurgulanmış bağlama duyarlı bir güvenlik modeli önerilmektedir. Bu çalışma kapsamında, muhtemel güvenlik açıkları ve gereksinimler tanımlanmış daha sonra model tasarlanmıştır. Konseptsel tasarımın yanı sıra, modelin üzerinde uygulandığı bütüncül bir test ortamı geliştirilmiştir. Son olarak ise modeli hem teorik olarak hem de pratik olarak doğrulamaktayız.

Tarih: 27.01.2020 / 16:00 Yer: Konferans Salonu-1


Turkish

Mustafa Teke, Çoklu-Yıl Zaman Serisi Ürün Sınıflandırma

Fenoloji vektörleri arasındaki açısal mesafeye göre bükme gerçekleştiren vektör dinamik zaman bükme algoritması geliştirilmiştir. Testler, önerilen VDTW yönteminin farklı tarım uygulamalarını, iklim ve atmosferik etkileri ve yıllar arasındaki ölçüm hatalarını telafi eden zamansal ve spektral değişimlere karşı gürbüz olduğunu göstermektedir. Ayrıca, sınırlı veri ile yüksek sınıflandırma doğruluklarına izin veren optimal zaman penceresini belirlemek için bir yöntem de geliştirilmiştir. Testlerde, 2013-2015 yılları arasında Harran Ovası’nda pamuk ve mısır, Bismil Ovası’nda mısır, pamuk ve soya fasülyesi ürünlerini içeren zaman serisi Landsat 8 uydu görüntüleri kullanılmıştır. Bunun yanında, 2017 ve 2018 yıllarında ABD, Kansas'taki VDTW mısır ve soya fasulyesini Harmonize Landsat Sentinel (HLS) verileriyle testler gerçekleştirildi.

Tarih: 15.01.2020 / 14:00 Yer: Konferans Salonu-1

Turkish

Ülkü Arslan Aydın, Yüz Yüze İletişime Bakış Merkezli Çok Modlu Yaklaşım

Face-to-face conversation implies that interaction should be characterized as an inherently multimodal phenomenon involving both verbal and nonverbal signals. Gaze is a nonverbal cue that plays a key role in achieving social goals during the course of conversation. The purpose of this study is twofold: (i)to examine gaze behavior (i.e., aversion and gaze on face) and relations between gaze and speech in face to face interaction, (ii)to construct computational models to predict gaze behavior using high-level speech features.

Tarih: 13.01.2020 / 10:30 Yer: Konferans Salonu-1

Turkish

Pages

Subscribe to RSS - PhD Thesis