Bu çalışmada, kinaz ailelerinin hassasiyetini belirlememizi sağlayan farklı HSK hücre-hatlarından elde edilen sitotoksik bioaktivite değerlerini kullanarak bir regresyon modeli geliştirdik. Bu modeli kinazların insan kinom ağacındaki topolojisini kullanarak düzenledik. Amacımız regresyon modeli ile hesapladığımız hassasiyet değerlerini kullanarak kinaz inhibitörlerinin hedef-dışı etkilerini hesaplayabilmektir. Oluşturduğumuz regresyon modelinin performansını, KanSiL veri seti kullanarak test ettiğimizde, başarılı sonuçlar gözlemledik. Bir sonraki adımda, geliştirdiğimiz metodu diğer veri setlerine uyguladık (CCLE ve GDSC). Önerdiğimiz model ile yapılan analiz sonucunda kinaz inhibitörleri sahip oldukları RMSE değerine göre aykırı ve aykırı olmayanlar şeklinde gruplanmıştır. Bu farklılık bize bu metod ile seçici ve seçici olamayan kinaz inhibitörlerini belirleyebileceğimizi göstermektedir.

Tarih: 06.09.2019 / 10:00 Yer: A-108

Bu tezin ilk bölümünde, VR, MR ve kişisel bilgisayar (PC) ortamları için Bina Bilgi Modellemesi'ne (BIM) dayanan bir mimari görselleştirme ve tasarım aracı geliştirilmiştir. BIM, binaları ve altyapıları verimli bir şekilde geliştirebilmeleri ve yönetebilmeleri için profesyonellere ayrıntılı bilgi ve araçlar sunmaktadır. Tezin ikinci bölümünde ise, kullanıcıların genel deneyimini geliştirmek ve sanal ortamlardaki kullanıcı etkileşimlerini kolaylaştırmak için VR ve MR ortamlarına dayanan öğretici iki ciddi oyun geliştirilmiştir. Geliştirilen araç ve ciddi oyunlar, mimarlar ve oyun geliştiricileri tarafından test edilmiştir ve buradalık, kullanılabilirlik ve teknoloji kabulü perspektifleri açısından değerlendirilmiştir.

Tarih: 29.08.2019 / 16:00 Yer: A-212

Konuşmadan çıkarılan özellikler, biyometrik konuşmacı tanıma gibi sorunlar için yaygın olarak kullanılır, ancak konuşma verilerinin kullanılması gizlilikle ilgili endişeleri doğurur. Sadece nefes verilerini kullanarak konuşma ve duruş sınıflandırması için bir yöntem öneriyoruz. Akustik bilgi Hilbert-Huang dönüşümü kullanılarak nefes örneklerinden elde edildi ve sınıflandırma için CNN-LSTM ağımıza beslendi. Ayrıca 4 farklı mikrofonla 5 farklı duruşta, 20 katılımcının 4600'den fazla nefes örneğini içeren halka açık veri setimiz BreathBase'i oluşturduk. Bu veriler kullanılarak,% 56 konuşmacı sınıflandırması ve% 96 duruş sınıflandırması doğruluğu elde edilmiştir.

Tarih: 02.09.2019 / 11:00 Yer: A-212

Genomdaki değişikliklerin birikmesi tümör oluşumuna sebep olabilir. En ölümcül beyin tümörü çeşitlerinden Glioblastoma onu tedavi edilemez kılan genomik çaşitliliği ile tanınır. Bu tez çalışmasında, TCGA’ deki Glioblastoma hastalarının mutasyon profillerini kuallanarak, hastalar arası çeşitliliği azaltmayı, onları gruplara ayırıp her bir gruba özel ilaç önerilerinde bulunmayı amaç edindik. Bu nedenle, mutasyonların üç boyutlu uzamsal organizasyonları (mutasyon birikim bölgeleri), protein etkileşim ağlarındaki organizasyonları ve Glioblastoma hücre hatlarının ilaç yanıtlarını kullanan sistem düzeyinde bir yaklaşım uyguladık.

Tarih: 28.08.2019 / 11:00 Yer: A-212

Bilgisayar destekli gerçekçi görüntülere oyun ve film gibi birçok uygulama alanında yüksek talep vardır. Ateş, duman, sis gibi belirli doğal olayların karmaşık karakteristiklerinden dolayı, bu efektleri gerçekçi şekilde taklit etmek zordur. 3B yapay oluşumları görsel olarak gerçekçi şekilde sentezlemek için farklı yaklaşım metodları vardır. Akış alanlarının partiküllerin hareketlerin yönlendirmek için kullanımı rastlantısal ve doğal görünen bir etki oluşturur. Bu çalışmanın amacı akış alanları kullanarak gerçekçi 3B görsel efektler oluşturmaktır.

Tarih: 06.09.2019 / 11:00 Yer: A-212

Tezimizde, hafif kripto algoritmalarının uygunluğu ve uyumluluğunu inceleyip, Nesnelerin İnterneti cihazlarındaki performanslarını standart algoritmalarla karşılaştırdık. Algoritma uygulamamızı, birçok gömülü sistemde yaygın olarak kullanılan ve düşük fiyat ve performans oranı nedeniyle hedef platform olarak tercih edilen Arduino Uno üzerinde gerçekleştirdik. Araştırmamızda kripto protokollerinin temel bileşenini oluşturan blok şifreler üzerine odaklandık. Internet Protolü Güvenliği (IPsec) suiti ve Datagram Taşıma Katmanı Güvenliği (DTLS) protokolleri bunlar arasında en çok bilinen ve ortak olarak kullanılanlardandır. Çalışmamızla, Nesnelerin İnterneti cihazlarındaki mevcut ve gelecek hafif IPsec ve DTLS ve diğer güvenlik protokollerinin gerçeklemeleri için rehber olacak sonuçlar sağlamayı hedefliyoruz

Tarih: 26.07.2019 / 13:00 Yer: A-212

Bu tezde üç farklı at ailesinin YNS verilerini analiz ederek bir jenerasyonda ortaya çıkan de novo mutasyonları tespit etmeyi hedefledik. Daha yüksek okuma derinliğine sahip olan veride daha yüksek sayıda gerçek pozitif bulurken, daha düşük okuma sayısına sahip olan veride daha düşük sayıda bulduk. Ek olarak at ailelerinin tarihlerine dair tahmin yürütebilmek için PSMC ve ROH analizleri yaptık. Analiz sonuçlarını önceki çalışmaların sonuçlarıyla uyumlu bulduk. Sonuçta de novo mutasyonların tespit edilmesi ve popülasyon tarihine dair tahmin yapabilmek için gereken tüm genom sekanslama verisinin minimum okuma sayısı ve kalitesine dair fikir edindik.

Tarih: 29.07.2019 / 11:00 Yer: A-212

Yaklaşık 10,000 yıl önce batı Avrasya’da başlayan Neolitik Geçiş insan yaşamında büyük değişikliklere yol açmıştır. Birçok çalışmada, bu değişikliklere bağlı adaptasyonlar tespit edilmiştir. Gelişen arkeogenomik çalışmaları sayesinde, bu adaptasyonlar antik DNA analizleriyle desteklenmektedir. Bu çalışmada, Neolitik sonrası Anadolu’daki poligenik adaptasyonlar, antik ve modern DNA karşılaştırmasıyla incelenmiştir. Beslenme, bağışıklık ve çeşitli kompleks özellikleri içeren 40 poligenik fenotip için Neolitik (n=36) ve günümüz (n=26) Anadolu bireylerinin arasında genetik uzaklıklar F_ST istatistiğiyle hesaplanmış ve genomda seçilimden direkt etkilenmeyen bölgelerle karşılaştırılmıştır. Ayrıca, Neolitik, modern Anadolu ve Afrika popülasyonu arasında yapılan genom boyu seçilim analizi ile modern Anadolu dalına özgü seçilim sinyalleri tespit edilmeye çalışılmıştır.

Tarih: 29.07.2019 Yer: A-212

Bu tez çalışmasında sunulan varış yönü kestirme yöntemleri araştırılmıştır. Özgün bir varış yönü kestirme yöntemi olan HiGRID ve bu metodun EB-MUSIC ve DPD test ile kombinasyonları sunulmuştur. Küresel mikrofon dizisi ses ortamının küresel harmonik analizi kolaylaştırmaktır ve sunulan yöntemler küresel harmonik analizi baz almaktadır. Sunulan yöntemlerin değerlendirilmesi varış yönü kestirme hata miktarları hesaplanarak sunulmuştur.

Tarih: 26.07.2019 Yer: A-212

Yapay çınlanımcılar, oyunlar ve arttırılmış gerçeklik uygulamaları için tam ölçekli oda akustiği simülasyon yöntemlerine nazaran uygulanabilir ve daha hızlı bir alternatif sunar. Saçılımlı gecikme ağları, bir dikdörtgen odanın geometrisi üzerinde doğrudan parametrik kontrol sağlayan nispeten yeni bir yapay çınlanımlayıcıdır. Bir açıklık aracılığıyla bağlanmış odalar için klasik SGA yapısını genişleten, bağlanmış hacimli saçılımlı gecikme ağları (BH-SGA) adı verilen yeni bir model öneriyoruz. Bu yeni model, hacimlerin akustik özelliklerinin ve bağlantı açıklığının boyutunun bağımsız kontrolünü sağlar. Önerilen yöntemin faydası, dürtü tepkilerinden elde edilen enerji bozulma eğrileri ile gösterilmiştir.

Tarih: 26.07.2019 Yer: A-212