M.S. Thesis

M.S. Thesis

Cansu Dinçer, Glioblastoma Hastaları Mutasyon Profillerinin 3 Boyutlu Uzamsal Organizasyonu ve Ağ Güdümlü Karşılaştırılması

Genomdaki değişikliklerin birikmesi tümör oluşumuna sebep olabilir. En ölümcül beyin tümörü çeşitlerinden Glioblastoma onu tedavi edilemez kılan genomik çaşitliliği ile tanınır. Bu tez çalışmasında, TCGA’ deki Glioblastoma hastalarının mutasyon profillerini kuallanarak, hastalar arası çeşitliliği azaltmayı, onları gruplara ayırıp her bir gruba özel ilaç önerilerinde bulunmayı amaç edindik. Bu nedenle, mutasyonların üç boyutlu uzamsal organizasyonları (mutasyon birikim bölgeleri), protein etkileşim ağlarındaki organizasyonları ve Glioblastoma hücre hatlarının ilaç yanıtlarını kullanan sistem düzeyinde bir yaklaşım uyguladık.

Tarih: 28.08.2019 / 11:00 Yer: A-212

Cansu Dinçer, Glioblastoma Hastaları Mutasyon Profillerinin 3 Boyutlu Uzamsal Organizasyonu ve Ağ Güdümlü Karşılaştırılması

Turkish

Müge Değirmenci Camcı, Akış Alanları Kullanarak Gerçekçi 3B Yapay Oluşumların Sentezi

Bilgisayar destekli gerçekçi görüntülere oyun ve film gibi birçok uygulama alanında yüksek talep vardır. Ateş, duman, sis gibi belirli doğal olayların karmaşık karakteristiklerinden dolayı, bu efektleri gerçekçi şekilde taklit etmek zordur. 3B yapay oluşumları görsel olarak gerçekçi şekilde sentezlemek için farklı yaklaşım metodları vardır. Akış alanlarının partiküllerin hareketlerin yönlendirmek için kullanımı rastlantısal ve doğal görünen bir etki oluşturur. Bu çalışmanın amacı akış alanları kullanarak gerçekçi 3B görsel efektler oluşturmaktır.

Tarih: 06.09.2019 / 11:00 Yer: A-212

Müge Değirmenci Camcı, Akış Alanları Kullanarak Gerçekçi 3B Yapay Oluşumların SenteziMüge Değirmenci Camcı, Akış Alanları Kullanarak Gerçekçi 3B Yapay Oluşumların Sentezi

Turkish

Selahattin Polat, Nesnelerin Interneti Güvenliği İçin Hafif Kripto Algoritmalarinin Performans Değerlendirmesi

Tezimizde, hafif kripto algoritmalarının uygunluğu ve uyumluluğunu inceleyip, Nesnelerin İnterneti cihazlarındaki performanslarını standart algoritmalarla karşılaştırdık. Algoritma uygulamamızı, birçok gömülü sistemde yaygın olarak kullanılan ve düşük fiyat ve performans oranı nedeniyle hedef platform olarak tercih edilen Arduino Uno üzerinde gerçekleştirdik. Araştırmamızda kripto protokollerinin temel bileşenini oluşturan blok şifreler üzerine odaklandık. Internet Protolü Güvenliği (IPsec) suiti ve Datagram Taşıma Katmanı Güvenliği (DTLS) protokolleri bunlar arasında en çok bilinen ve ortak olarak kullanılanlardandır. Çalışmamızla, Nesnelerin İnterneti cihazlarındaki mevcut ve gelecek hafif IPsec ve DTLS ve diğer güvenlik protokollerinin gerçeklemeleri için rehber olacak sonuçlar sağlamayı hedefliyoruz

Tarih: 26.07.2019 / 13:00 Yer: A-212

Turkish

Elif Bozlak, Trıo Verisi ile De Novo Snp Çağırma ve Demografik Geçmiş Analizi

Bu tezde üç farklı at ailesinin YNS verilerini analiz ederek bir jenerasyonda ortaya çıkan de novo mutasyonları tespit etmeyi hedefledik. Daha yüksek okuma derinliğine sahip olan veride daha yüksek sayıda gerçek pozitif bulurken, daha düşük okuma sayısına sahip olan veride daha düşük sayıda bulduk. Ek olarak at ailelerinin tarihlerine dair tahmin yürütebilmek için PSMC ve ROH analizleri yaptık. Analiz sonuçlarını önceki çalışmaların sonuçlarıyla uyumlu bulduk. Sonuçta de novo mutasyonların tespit edilmesi ve popülasyon tarihine dair tahmin yapabilmek için gereken tüm genom sekanslama verisinin minimum okuma sayısı ve kalitesine dair fikir edindik.

Tarih: 29.07.2019 / 11:00 Yer: A-212

Turkish

Evrim Fer, Anadolu’da Neolitik ve Günümüz İnsan Genomlarının Karşılaştırılmasıyla Poligenik Özelliklerle İlişkili Aleller Üzerinde Doğal Seçilim Tespiti

Yaklaşık 10,000 yıl önce batı Avrasya’da başlayan Neolitik Geçiş insan yaşamında büyük değişikliklere yol açmıştır. Birçok çalışmada, bu değişikliklere bağlı adaptasyonlar tespit edilmiştir. Gelişen arkeogenomik çalışmaları sayesinde, bu adaptasyonlar antik DNA analizleriyle desteklenmektedir. Bu çalışmada, Neolitik sonrası Anadolu’daki poligenik adaptasyonlar, antik ve modern DNA karşılaştırmasıyla incelenmiştir. Beslenme, bağışıklık ve çeşitli kompleks özellikleri içeren 40 poligenik fenotip için Neolitik (n=36) ve günümüz (n=26) Anadolu bireylerinin arasında genetik uzaklıklar FST istatistiğiyle hesaplanmış ve genomda seçilimden direkt etkilenmeyen bölgelerle karşılaştırılmıştır. Ayrıca, Neolitik, modern Anadolu ve Afrika popülasyonu arasında yapılan genom boyu seçilim analizi ile modern Anadolu dalına özgü seçilim sinyalleri tespit edilmeye çalışılmıştır.

Tarih: 29.07.2019 Yer: A-212

Turkish

Orhun Olgun, Mikrofon Dizinleri için Entropi Temelli Varış Yönü Kestirme Yöntemleri

Bu tez çalışmasında sunulan varış yönü kestirme yöntemleri araştırılmıştır. Özgün bir varış yönü kestirme yöntemi olan HiGRID ve bu metodun EB-MUSIC ve DPD test ile kombinasyonları sunulmuştur. Küresel mikrofon dizisi ses ortamının küresel harmonik analizi kolaylaştırmaktır ve sunulan yöntemler küresel harmonik analizi baz almaktadır. Sunulan yöntemlerin değerlendirilmesi varış yönü kestirme hata miktarları hesaplanarak sunulmuştur.

Tarih: 26.07.2019 YerA-212

Orhun Olgun, Entropy-based Direction-of-Arrival Estimation Methods for Rigid Spherical Microphone Arrays

Turkish

Timuçin Berk Atalay, Açıklık Kontrollü Saçılımlı Gecikme Ağları ile Çift Hacim Akustiği Simülasyonu

Yapay çınlanımcılar, oyunlar ve arttırılmış gerçeklik uygulamaları için tam ölçekli oda akustiği simülasyon yöntemlerine nazaran uygulanabilir ve daha hızlı bir alternatif sunar. Saçılımlı gecikme ağları, bir dikdörtgen odanın geometrisi üzerinde doğrudan parametrik kontrol sağlayan nispeten yeni bir yapay çınlanımlayıcıdır. Bir açıklık aracılığıyla bağlanmış odalar için klasik SGA yapısını genişleten, bağlanmış hacimli saçılımlı gecikme ağları (BH-SGA) adı verilen yeni bir model öneriyoruz. Bu yeni model, hacimlerin akustik özelliklerinin ve bağlantı açıklığının boyutunun bağımsız kontrolünü sağlar. Önerilen yöntemin faydası, dürtü tepkilerinden elde edilen enerji bozulma eğrileri ile gösterilmiştir.

Tarih: 26.07.2019 Yer: A-212


Turkish

Ozan Emirhan Bayyurt, İnteraktif Hikaye ve Rol Yapma Oyunlarına Odaklı Bir Oyun Geliştirme Sisteminin Tasarlanması ve İmplementasyonu

Video oyunları hikaye anlatımı için harika araçlardır. Bu tez oyun geliştiricilere rol yapma oyunlarını çok daha kolay ve hızlı bir şekilde geliştirmelerine yardımcı olacak bir oyun geliştirme yazılım çerçevesi önermektedir. Modüler yapısı sayesinde önerilen yazılım geliştirme çerçevesi oyun geliştiricilere son derece ölçeklenebilir bir oyun geliştirme ortamı sunar.

Tarih: 23.07.2019 10:00 Yer: Bilgisayar Mühendisliği A-105

Ozan Emirhan Bayyurt, İnteraktif Hikaye Ve Rol Yapma Oyunlarına Odaklı Bir Oyun Geliştirme Sisteminin Tasarlanması Ve İmplementasyonu

Turkish

Necati Çağatay Gürsoy, Yapay Sinir ağlarında Yaşlar Arası Etki: Yapay Sinir Ağlarında Yüzsel Yaş Tanımlama Sapmasına Dair Bir Araştırma

Kısaca, yaşlar arası etki veya kendi-yaş sapması kişilerin yüzlerden yaş tahmini yaparken tahmin yapan kişinin kendi yaşının yaptığı tahmine olan ve tahmini kişinin kendi yaşına doğru olan etkisini ifade eden bir görüngüdür. Araştırmamızın ilk kısmında bu görüngü insanlar üzerinde iddia edilen etkinin var olup olmadığı yönünde sınanmıştır. Daha sonra bu etkinin yol açtığı hataların en aza indirilebilmesi için evrişimli sinir ağları kullanılarak yüz görüntüleri yaşlara göre sınıflandırılmıştır.

Tarih: 27.06.2019 16:30 Yer: A-212

Turkish

Salih Fırat Canpolat, Seste Duygu Tanımlaması Üstüne Yeni Bir Yaklaşım: Konvolusyonel Sinir Ağları ve Grad-Cam Oluşturulması

Araştırma Türkçe tek kelimelik seslendirmelerdeki duygu tanımlamasının obje tanımala perspektifinden incelemensesi üstüne kurulmuştur. CNN yaklaşımı bize eğitim materyali olarak spektrogram kullanma şansı verdi. Sonuçta oluşan model yeterli tahmin gücüne sahipt ve insan kodlayıcılar ile benzerlik göstermekte. Ses sinyalindeki yüksek frekanslarda olan değişimlere karşı dirençli ve genel olarak insan kodlayıcılardan 500-8000 hertz bandı haricinde daha iyi sonuç vermekte lakin bu aralıkta insna kodlayıcılar kayda değer bir tahmin gücü kaybetmemekte. Modelin, insanların sağlam olduğu 500-8000 hertz bandında başarılı sonuç vermemesi, insanların duyguları değerlendirme mekanizmaları konusunda önemli ipuçları sağlayabilir.

Tarih: 27.06.2019 13:30   Yer: A-108

Turkish

Pages

Subscribe to RSS - M.S. Thesis