Onur Erdoğan, EnSCAN: “En”semble “S”coring for Prioritizing “CA”usative Varia“N”ts Across Multi-Platform GWAS for Late-Onset Alzheimer's Disease
Bu çalışmada EnSCAN çerçevesini tanıtarak, farklı genotipleme platformlarında seçilen varyantları konsolide eden ve bu varyantları öncelikli aday lokus olarak sıralayarak her bir genotiplendirme platformundaki makine öğrenmesi sonuçlarından elde edilen önsel bilgiyi iyileştiren ve birleştiren yenilikçi bir algoritma önerilmektedir. Önerilen EnSCAN algoritması, varyatların kromozomal konumlarını sitogenetik bantlara göre haritalama ve çiftler arasındaki yakınlıkları ile çoklu model üzerinde Random Forest doğrulamalarını kullanarak SNV'leri ve Alzheimer Hastalığı için ayırt edici genleri önceliklendirmeyi sağlar. EnSCAN algoritmasındaki skorlama yöntemi ölçeklenebilir olup, herhangi bir çoklu platform genotipleme çalışmasına uygulanabilir durumdadır. Bu çalışmada EnSCAN skorlama algoritmasının, üç GWAS veri seti arasında LOAD ile ilişkili aday ayırt edici varyantlarını nasıl önceliklendirdiği sunulmaktadır.
Tarih: 06.09.2024 / 16:00 Yer: B-116









