Fatma Cankara, Tekil Amino Asit Mutasyonlarının Protein İşlevleri Üzerindeki Etkisinin Yapısal ve Anotasyon Odaklı Yaklaşımla Tahmini

Çalışmalar göstermiştir ki tekil amino asit değişiklikleri proteinlerin dizi, yapı ve işlevlerini değiştirerek pek çok hastalığa sebep olmaktadır. Ancak, bu değişiklikleri manuel olarak sınıflandırma ve karakterize etme hızı, halihazırda üretilen verinin hızına erişememektedir. Bu sebeple, bu işlemi kolaylaştırmak adına bilgisayar tabanlı uygulamalar geliştirilmekte ve yeni veriler üzerinde uygulanmaktadır. Bu çalışmada biz, sinonim olmayan tekli nükleotid değişikliklerinin amino asit seviyesinde gösterdikleri etkiler hakkındaki bilgileri çeşitli veri tabanlarından toplamak ve organize etmek, bu bilgiyi sonuçları bilinmeyen tekli nükleotid değişikliklerinin proteine zarar verme potansiyellerini gözetimli makine öğrenmesi sistemi kullanarak tahmin etmek için bir metodoloji sunuyoruz.

Tarih: 30.01.2020 / 14:00 Yer: A-212

Turkish

Eray Üstün, Baskın Direkt Yol ile Dördey Fourier Dönüşümleri Kullanarak Akustik Kaynak Yeri Belirleme

Yüksek Lisans Adayı: Eray Üstün
EABD: Çokluortam Bilişimi
Tarih: 23.01.2020 / 11:00
Yer: A-212

Özet: Akustik kaynak yeri belirleme önemli ve genişçe araştırılan bir konudur, çünkü robotik, sahne analizi ve takip alanlarında kullanılabilir. Akustik sahne analizi akustik basınç ve parçacık hızıyla tanımlanabilir. İlki sayısal bir değerken diğeri de vektörel bir değerdir. Akustik dalgaların bu özellikleri kullanılarak çok sayıda DOA yaklaşımı geliştirilmiştir. Klasik kompleks sayı sisteminin bir uzantısı olan ve dördey adı verilen 4-boyutlu bir sayı sistemi vardır. Dördeyler bir sayısal bileşenden ve 3-boyutlu vektör bileşeninden oluşmaktadır. Çok bileşenli sinyallerin bileşenlerini aynı anda işleyebilmesinden dolayı dördey Fourier dönüşümleri kullanışlıdır. Bu tezde dördeyleri kullanarak özgün bir sinyal modeli oluşturulmuş ve akustik yer belirleme için özgün bir yaklaşım sunulmuştur. Akustik ses alanı dördeyler tarafından ifade edilmiş ve QFT’ler kullanılarak işlenmiştir. QFT sonucunun çıktısına baskın direkt yol testi uygulanmış ve DOA kestirim vektörlerinin geometrik yerleşimi kullanılarak yer belirleme işi gerçekleştirilmiştir.

Announcement Category

Thesis defense

Oryantasyon Toplantısı Duyurusu

Sevgili Öğrencilerimiz,

2019-2020 Eğitim Öğretim Yılı  Bahar Döneminde programa yeni kabul edilen ve kayıt yaptıracak öğrencilerimiz ile tanışma ve bilgilendirme toplantısı yapılacaktır.

Toplantı bilgileri aşağıda belirtilmiştir.

Sağlık Bilişimi EABD Doktora Programı

29 Ocak 2020 Çarşamba günü saat 11.00'da II-06 numaralı sınıf

Çoklu Ortam Bilişimi Doktora ve Yüksek Lisans Programı

29 Ocak 2020 Çarşamba günü saat 10.00'da A-Blok Z-11 numaralı Öğrenci İşleri Ofisi

Toplantıya katılacak öğrencilerimiz; tarafımızca temin edilecek olan aşağıda isimleri belirtilen formları, idari danışmanları ile birlikte aynı gün içinde dolduracaklardır.

Öğrenci Bilgi Formu

Öğrenci Not formu

Bilimsel Hazırlık Formu

Yukarıda bildirilen formları eksiksiz doldurabilmek için öğrencilerimiz aşağıda belirtilen belgeleri toplantıya getirmeleri gerekmektedir.

1 Adet vesikalık resim

1 Adet Transkript (Doktora öğrencileri için Lisans ve Yüksek Lisans Transkripti)

* Toplantıya katılımın zorunlu olduğunu belirtir, programa kabul edilen öğrencilerimizi kutlar, kendilerine başarılar dileriz.

Announcement Category

Announcement

Rumeysa Fayetörbay, Hepatosellüler Karsinomda Hedefe Yönelik Moleküler Ajan Tedavilerinin Ağa Dayalı Keşfi

Sorafenib, hepatosellüler kanser tedavisindeki FDA onaylı hedeflenmiş ajanlardan biridir. PI3K/AKT yolağı primer (birincil) karaciğer kanserinin yaklaşık % 50'sinde değiştirilir, bu yüzden Sorafenib ve PI3K/AKT yolağı inhibitörlerinin sinyal verme seviyesinde nasıl etki ettiğinin anlaşılması, hedefe yönelik terapiler için çok önemlidir ve yan etkilerini (hedef dışı etkiler) ortaya çıkarır. Bu çalışmada biz yedi farklı ilaç/inhibitör ve onların kombinasyonu ile tedavi edilen hepatoselüler karsinom hücrelerinin (Huh7 ve Mahlavu) gen ekspresyon profillerini kullanıyoruz. Amacımız, bir ilaç tedavisindeki önemli hedefleri ve modülatörleri moleküler etkileşimlerin düzensizliğini anlayarak ortaya çıkarmaktır. Başka bir deyişle, biz ilaçların etki mekanizmasını genler listesinin haricinde bir ağ kaynağında araştırıyoruz.

Tarih: 13.01.2020 / 14:00 Yer: A-108

Turkish

Mustafa Teke, Çoklu-Yıl Zaman Serisi Ürün Sınıflandırma

Fenoloji vektörleri arasındaki açısal mesafeye göre bükme gerçekleştiren vektör dinamik zaman bükme algoritması geliştirilmiştir. Testler, önerilen VDTW yönteminin farklı tarım uygulamalarını, iklim ve atmosferik etkileri ve yıllar arasındaki ölçüm hatalarını telafi eden zamansal ve spektral değişimlere karşı gürbüz olduğunu göstermektedir. Ayrıca, sınırlı veri ile yüksek sınıflandırma doğruluklarına izin veren optimal zaman penceresini belirlemek için bir yöntem de geliştirilmiştir. Testlerde, 2013-2015 yılları arasında Harran Ovası’nda pamuk ve mısır, Bismil Ovası’nda mısır, pamuk ve soya fasülyesi ürünlerini içeren zaman serisi Landsat 8 uydu görüntüleri kullanılmıştır. Bunun yanında, 2017 ve 2018 yıllarında ABD, Kansas'taki VDTW mısır ve soya fasulyesini Harmonize Landsat Sentinel (HLS) verileriyle testler gerçekleştirildi.

Tarih: 15.01.2020 / 14:00 Yer: Konferans Salonu-1

Turkish

Emre Mülazımoğlu, Metin Tabanlı Captcha Araçlarında Görsel Özelliklerin Rolü: Kullanılabilirlilik İçin Fnırs Çalışması

Yüksek Lisans Adayı: Emre Mülazımoğlu
EABD: Siber Güvenlik
Tarih: 15.01.2020 / 11:00
Yer: A-108

Özet: Bilgi istemlerine yapılan sözlük veya benzer istenmeyen otomatik saldırıları önlemek için geliştiriciler tarafından genellikle güvenlik kodları (CAPTCHA) kullanılmaktadır. Bu güvenlik kodları sistemi kullananın otomatik yazılım veya gerçek kişi olup olmadığını anlamaya yaramaktadır. Güvenlik kodunun uygun şekilde uygulanması için kodun zorluğu ve kullanılabilirliği arasında bir denge kurmak gerekmektedir. Yapılan önceki çalışmalar kullanılabilirliği nicel olarak ölçümlemek için güvenli kodunun doğruluğu ve tepki süresini ölçümlemişlerdir. Bu çalışma güvenlik kodunun ölçümlenmesi için optik nöro görüntüleme tekniklerinin kullanılmasını amaçlamaktadır. Özellikle fNIRS (Functional Near Infrared Spectroscopy) beyindeki hemodinamik yanıtları analizi ile zihinsel iş yükünün ölçümlenmesi için kullanılan bir nöro görüntüleme tekniğidir. Bu çalışmada 25 katılımcının çeşitli metin tabanlı güvenli kodunun çözmesi ve ilgili katılımcıların zihinsel iş yükünün ölçümlenerek raporlanmasına yönelik deneysel uygulamalar içermektedir.

Announcement Category

Thesis defense

Ülkü Arslan Aydın, Yüz Yüze İletişime Bakış Merkezli Çok Modlu Yaklaşım

Face-to-face conversation implies that interaction should be characterized as an inherently multimodal phenomenon involving both verbal and nonverbal signals. Gaze is a nonverbal cue that plays a key role in achieving social goals during the course of conversation. The purpose of this study is twofold: (i)to examine gaze behavior (i.e., aversion and gaze on face) and relations between gaze and speech in face to face interaction, (ii)to construct computational models to predict gaze behavior using high-level speech features.

Tarih: 13.01.2020 / 10:30 Yer: Konferans Salonu-1

Turkish

Sağlık Bilişimi EABD Programı Mülakat Sonuçları

Sağlık Bilişimi EABD Doktora Programına, 2019-2020 Eğitim Öğretim Yılı Bahar dönem başvurularına ilişkin yapılan mülakatlar neticesinde programa kabul edilen öğrencilerin isimleri aşağıda belirtilmiştir.

* Programa yeni kabul edilen öğrencilerimizle ayrıca, etkileşimli kayıtlar haftasında oryantasyon toplantısı yapılacak olup, web sayfamız üzerinden toplantı tarih ve saat bilgileri yayınlanacaktır.

Doktora Programı Kabul Listesi

- DAMLA DOKUZOĞLU (Bilimsel Hazırlık)

- BURCU KARAKAYA (Bilimsel Hazırlık)

Announcement Category

Announcement

Çoklu Ortam Bilişimi Doktora ve Yüksek Lisans Programları Mülakat Sonuçları

Modelleme ve Simülasyon EABD Çoklu Ortam Bilişimi Doktora ve Yüksek Lisans Programlarına 2019-2020 Eğitim Öğretim Yılı Bahar dönemi başvurularına ilişkin yapılan mülakatlar neticesinde programa kabul edilen öğrencilerin isimleri aşağıda belirtilmiştir.

* Programa yeni kabul edilen öğrencilerimizle ayrıca, etkileşimli kayıtlar haftasında oryantasyon toplantısı yapılacak olup, web sayfamız üzerinden toplantı tarih ve saat bilgileri yayınlanacaktır.

DOKTORA KABULLERİ

Adı Soyadı
EGE ERDEM
OĞUZ HANOĞLU

YÜKSEK LİSANS KABULLERİ

Adı Soyadı
MUSTAFA KILINÇ
ELİF HİLAL KORKUT
ÖVGÜ ÖZDEMİR
ABDULLAH MERT TUNÇAY
MEHMET BURAKHAN YILDIZ

Announcement Category

Announcement

Pages

Subscribe to Enformatik Enstitüsü RSS