Elif Bozlak, Trıo Verisi ile De Novo Snp Çağırma ve Demografik Geçmiş Analizi
Bu tezde üç farklı at ailesinin YNS verilerini analiz ederek bir jenerasyonda ortaya çıkan de novo mutasyonları tespit etmeyi hedefledik. Daha yüksek okuma derinliğine sahip olan veride daha yüksek sayıda gerçek pozitif bulurken, daha düşük okuma sayısına sahip olan veride daha düşük sayıda bulduk. Ek olarak at ailelerinin tarihlerine dair tahmin yürütebilmek için PSMC ve ROH analizleri yaptık. Analiz sonuçlarını önceki çalışmaların sonuçlarıyla uyumlu bulduk. Sonuçta de novo mutasyonların tespit edilmesi ve popülasyon tarihine dair tahmin yapabilmek için gereken tüm genom sekanslama verisinin minimum okuma sayısı ve kalitesine dair fikir edindik.
Tarih: 29.07.2019 / 11:00 Yer: A-212