Enformatik Enstitüsü

Yüksek Lisans Adayı: Zafer Şengül

EABD: Siber Güvenlik

Tarih: 07.08.2019 / 09:45

Yer: A-212

Özet: Kötü amaçlı yazılımlar, istenmeyen sistem davranışlarına neden olan ve genellikle BT sistemlerine veya kullanıcılarına zarar veren kötü amaçlı programlardır. Bu etkiler askeri operasyonlar sırasında da görülebilir, çünkü yüksek teknoloji ürünü askeri silahlar, komuta, kontrol ve haberleşme sistemleri de birbirine bağlı BT sistemleridir. Bu tezde, kötü amaçlı yazılımların bağlı sistemlerdeki yayılmasını araştırmak için biyolojik hastalıkların yayılımını modellemek için kullanılan geleneksel modeller kullanılmıştır. Özellikle, kötü amaçlı yazılımların yayılmasını karakterize etmek kullanılan karma salgın modeli ve savaş modellerinin araştırılmasında bir çerçeve geliştirmek için Bayes Ağı analizi gibi olasılıksal bir öğrenme yaklaşımı önermektedir. Formüle dayalı temsiller kullanan klasik modellerle karşılaştırıldığında, bu tezin sonuçları, bir askeri gücün diğerine göre üstünlüğünün olasılıksal açıdan daha zenginleştirilmiş temsillerini ortaya koymaktadır

Yüksek Lisans Adayı: Habibe Cansu Demirel

EABD: Biyoenformatik

Tarih: 31.07.2019 / 10:00

Yer: A-108

Özet: Alternatif uç birleştirme proteomun ve sonrasında interaktomun çeşitliliğine katkı sağlayan önemli transkripsiyon sonrası mekanizmalardan biridir. Tek bir genden, farklı yapılara sahip birden çok proteinin üretilmesine imkan verir. Etkileşim ağları açısından bakıldığında ise bu yapısal değişiklikler yeni etkileşimlerin kazanılmasına ya da var olan etkileşimlerin kaybedilmesine yol açabilir. Alternatif uç birleştirme olaylarındaki değişimler kanser de dahil olmak üzere farklı hastalıklarla ilişkilendirilmiştir. Bu çalışmada, tümöre özgü protein izoformlarını ve bu izoformların sebep olduğu etkileşim kayıplarını dahil ederek hastaya özel etkileşim ağları oluşturduk. Bu amaçla, Kanser Genom Atlası’ndan (TCGA) elde ettiğimiz 400 meme kanseri ve 112 sağlıklı doku RNA-seq verisini kullanarak tümör örneklerinde artmış ekspresyon gösteren transkriptleri bulduk. Bu transkriptleri UniProt’ta bulunan izoformlarla eşleştirdik. Ayrıca, birkaç kaynaktan alınan verilerle bir yapısal interaktom oluşturduk ve izoformlarda bulunan eksik bölgeleri bilinen ya da tahmin edilmiş protein ara yüzleriyle karşılaştırarak potansiyel etkileşim kayıplarını çıkardık. Böylece, her bir örnek için, biri baskın izoformların (terminal seti) yol açtığı etkileşim kayıplarına göre diğeriyse ekspresyona göre filtrelenmiş iki interaktom elde ettik. Sonrasında, Omics Integrator aracını her iki interaktom için aynı terminal setiyle çalıştırarak her bir örnek için iki farklı etkileşim ağı seti elde ettik. Son olarak çıkan iki farklı etkileşim ağını ve oluşturulan tüm etkileşim ağlarını karşılaştırarak hastaları benzerliklerine göre gruplandırabilecek yolak, etkileşim ve protein düzenlerini açığa çıkardık. Bu çalışmanın sonuçlarının tümör gelişimiyle ilgili mekanizmaları aydınlatması ve ayrıca kanserde hastaya özgü tedavi yöntemleri ve hedef seçimi ile ilgili çalışmalara katkıda bulunması beklenmektedir.

Doktora Adayı: Emre Süren

EABD: Bilişim Sistemleri

Tarih: 06.08.2019 / 16:30

Yer: Konferans Salonu 01

Özet: İstismar Kitlerinin (İK) yaygınlığı ve durmaksızın gelişen teknik karmaşıklığı, modern siber suç ekosistemindeki en önemli kırlmalardan bir tanesidir. Son birkaç yıldır, izinsiz yükleme saldırları vasıtasıyla yapılan zararlı yazılım enfensiyonları, İK'ler tarafından gerçekleştirilmektedir. Bir İK, birçok türden zararlı içeriği çeşitli tehdit vektörleri aracılığıyla, farklı saldırı teşebbüsleri için servis etmektedir, ki bir çoğu parasal odaklıdır. Bu doktora tezinde, İK ailelerine yönelik yapılan bağlam bilinçli içerik analizinin sonuçları ile, ki orada bağlam bilinçli öznitelikler tespit edilmiştir, İK filozofisine ve iç yapısına dair derinlemesine bir müzakere sağlanmıştır. Anahtar bulgu ise, farklı sızma olaylarında analiz edilen İK'lere ait ağ sayfaları bir birinden çok farklıyken, URL adreslerindeki yapıların birbirlerine benzer olması ve otomatik olarak üretilen URL adreslerinin kendine has bir modeli takip etmesidir. Yürürlükteki bu pratik, sorumlu İK örnekleri için, etkili bir sistemin geliştirilmesine olanak sağlamıştır. Bu kapsamda, İK ailelerini hızlı ve yüksek doğrulukta kategorize etmek için makine öğrenmesi kullanan, yeni bir ince teknik ve özgün URL öznitelik seti öne sürülmüştür. 'Baştanbaşa URL yapıları' tekniği, her URL adresini ayrı ayrı bağımsız bir şekilde analiz etmek yerine, İK enfeksiyonuyla ilişkili olan bütün URL adreslerini birlikte inceler. Metot en güncel, 2016 yılı boyunca en yaygın olan 4 İstismar Kiti vasıtasıyla zararlı yazılım bulaşmasıyla sonuçlanan gerçek dünya vakalarından oluşan, 2250 adetin üzerinde URL adresini kapsayan 240 farklı olayın bulunduğu muteber bir veri kümesiyle değerlendirilmiştir. Bu sistem, % 93.7 oranına varan kesinlikte kümeleme ve % 100.0 doğruluğa varan sınıflandırma değerlerine ulaşmaktadır.

Sempozyum broşürüne buradan ulaşılabilir.

Yüksek Lisans Adayı: Amin Zabardast

EABD: Sağlık Bilişimi

Tarih: 07.08.2019 / 14:00

Yer: A-108

Özet: En-az-girişimsel cerrahi yöntemler cerrrahlara uyguladıkları operasyonlarda yüksek başarı sağlamalarına, olası riskleri azaltarak, onlara işlevsel araçlar kazandırma ve daha iyi bir perpektif sağlayan teknolojik imkanlar sunarlar. Cerrahlar en-az-girişimsel cerrahi operasyonlar sırasında (Laparoskopik, Endoskopik veya Robotik cerrahi) genellikle ekrandaki görüntülere ve kameralara bağlı çalışırlar. Ameliyathanelerde farklı görüntüleme kiplerinden gelen bilgi (görüntüler) kullanılır (Bilgisayarlı Tomografi, Manyetik Resonans gibi). Ancak, bu bilgiler kamera görüntüleriyle bütünleştirilmez ve bu bilginin çıkartılarak birleştirilmesi ancak cerrahın deneyim ve yetenekleriyle sınırlı kalır. Klasik kameralar, çok faydalı olmakla birlikte, olayın her yönünü (mesela derinlik bilgisi) iletmekte yeterli olmazlar. Son yıllarda, steryo kameralar ameliyathanelerde kullanıma sunulmuştur. Steryo endoskopik araçlar ve beraberindeki algoritmalar derinlik algılamasına yardımcı olurlar. Derinlik bilgisinin steryo kameralardan çıkarımını sağlayan yöntemler (‘steryo uyuşma’ olarak bilinir) halen bilgisayar bilimleri alanında aktif bir araştırma alanıdır. 3 boyutlu ortamın sayısal oluşturulması için gerekli basamak derinlik bilgisidir. Bu bilgi, cerraha yardımcı olacak olan ‘eklenmiş gerçeklik’ ortamı oluşturmak için temel teşkil eder. Yapay Sinir Ağları (YSA) ve özellikle de Evrişimsel Sinir Ağları (ESA) son yıllarda bilgisayarlı görü alanındaki araştırmalarda çığır açmıştır. Araştırmacıların YSA kullanarak çözmeye çalıştığı konuların arasında ‘steryo uyuşma’ da vardır. Steryo uyuşma konusunda ESA’nın değişik türleri oldukça iyi başarım göstermiştir. Bu tez çalışması, derin sinir ağları ve bilgisayar benzetimleri kullanarak, hayvan organ dokularından alınmış steryo görüntülerinde yüzey geri-çatım problemini hedeflemiştir.