Enformatik Enstitüsü

Bu tez, anlamsal bölütleme için piksel düzeyinde etiketlenmiş veri ihtiyacını azaltmayı amaçlamaktadır. Sentetik görüntüler üzerinde eğitilen DeepLabV3+ tabanlı bir model, gerçek görüntülere uyum sağlamak için bir çekişmeli alanı uyarlaması yöntemi olan Domain-Adversarial Neural Network (DANN) ile desteklenmiştir. Model, denetimsiz ve yarı denetimli etki alanı uyarlama senaryolarında uygulanmıştır. Özellikle yarı denetimli uyarlama yönteminde, denetimli öğrenme ile eğitilen ve etki alanı uyarlaması yapılmayan DeepLabV3+ yöntemine kıyasla %92 daha az etiketli gerçek veri kullanılarak benzer performans elde edilmiştir. Bu çalışma, görüntü etiketleme yükünü azaltan etkili bir çözüm sunmaktadır.

Tarih: 26.05.2025 / 15:00 Yer: A-212

Obscurin ve Trio protein ailelerinin ortak evrimsel kökeni, filogenetik analizler yoluyla tanımlanmış ve omurgalı soyları boyunca gerçekleşmiş yapısal alan takaslama olaylarına işaret etmiştir. Bu bulgular temel alınarak, TrioN-benzeri DH domainleri için yeni bir varyant etkisi tahmin etme aracı olan TrioNsight geliştirilmiştir. Yapısal, evrimsel ve fizyokimyasal özelliklerden yararlanan bu araç, patojenik varyantları ayırt etmede yüksek doğruluk sağlamıştır (MCC: 0.906; 1.0 mükemmel performansı temsil eder). Bu çalışma, temel evrimsel biyoloji ile klinik uygulamaları birleştirerek hem protein ailelerinin evrimine dair mekanistik bulgular hem de işlevsel olarak kritik yapısal alanlarda hastalıkla ilişkili varyantların yorumlanmasına yönelik pratik bir araç sunmaktadır.

Tarih: 30.05.2025 / 10:00 Yer: A-212

Tarih: 26.05.2025 / 10:30 Yer: B-116

Kompleks tat algısı ve bağırsak-beyin iletişimi, yeme davranışını etkiler. Vagus siniri (VN), yüksek kalorili gıdalara karşı duyarsızlaşarak aşırı yemeyi tetikleyebilir; bu süreç VN uyarımıyla tersine çevrilebilir. Bu çalışma, çikolatalı milkshake tüketimi sırasında oluşan sinirsel aktivitenin transkütanöz VNS (tVNS) tarafından modüle edilip edilmediğini EEG ile inceledi. Temel bulgular: (1) Gıda alımı sonrası spontan göz kırpma oranları (dopamin göstergesi) arttı, dopaminerjik süreçlerin aktivasyonuna işaret etti. (2) Yutma ile senkronize edilen olayla ilişkili potansiyeller (ERP’ler) yalnızca gıda uyaranı varlığında gözlendi; bu, yudumlama-yutma protokolünün kompleks tat araştırmaları için kullanılabileceğini destekledi. (3) Dinlenme halindeki beyin dalgaları veya ERP’ler üzerinde anlamlı tVNS etkisi bulunmadı, ancak yöntem gıdaya özgü sinirsel tepkileri tespit etti. Bu sonuçlar, protokolün gelecekteki bağırsak-beyin ekseni çalışmaları için kullanışlılığını da desteklemektedir.

Tarih: 14.04.2025 / 14:00 Yer: A-212

Bu tez, Gelişmiş Veri Analitiği (ADA) projelerinin başarısında insanların ve kültürle ilgili yeteneklerin kritik rolünü araştırarak, ağırlıklı olarak teknik yönlere odaklanan mevcut literatürdeki bir boşluğu ele almaktadır. Sistematik bir literatür incelemesi ve yarı yapılandırılmış görüşmeler gerçekleştirerek, çalışma bu yetenekleri belirleyip kategorilere ayırarak, bunları İnsan Yetenek Olgunluk Modeli'nden (Curtis vd., 2009) uyarlanmış yapılandırılmış süreçlere entegre etmektedir. Araştırma, iş gücü hazırlığını, iş birliğini ve kurumsal kültürü geliştirmek için eyleme geçirilebilir çerçeveler ve uygulamalar sunarak işletmelerin ADA girişimlerini stratejik hedeflerle uyumlu hale getirmelerini ve sürdürülebilir başarıya ulaşmalarını sağlamaktadır.

Tarih: 10.01.2025 / 13:30 Yer: A-212

Kodlamayan bölgelerdeki somatik mutasyonlar, transkripsiyon faktörü (TF)-DNA etkileşimlerini bozarak gen düzenlemesini etkiler ve kansere katkıda bulunabilir. Bu tezde, somatik mutasyonların TF bağlanma afiniteleri üzerindeki etkisini değerlendiren bir in silico analiz hattı geliştirilmiştir. 403 TF için ChIP-seq ve PBM verileri kullanılarak eğitilen modellerle, 560 meme kanseri örneği incelenmiştir. Tahmin edilen TF bağlanma değişiklikleri kazanç veya kayıp fonksiyonu olarak sınıflandırılmış ve mutasyonla ilişkili hızlandırıcı-hedef gen haritalarıyla ilişkilendirilmiştir. Bu çalışma, istatistiksel analizlerle mutasyonel imza merkezli farklı desenler ve bulgular ortaya koyarken, somatik mutasyonların kanser üzerindeki düzenleyici rolüne dair önemli bilgiler sunmuştur.

Tarih: 07.01.2025 / 10:00 Yer: A-212

Tez, üretimde alarm yönetim sistemlerinin optimize edilmesini tartışmaktadır. Alarm parametrelerini geliştirmek için Tennessee Eastman Sürecini kullanan, gözden kaçan kritik alarmları azaltmayı ve proses güvenliğini iyileştirmeyi amaçlayan yeni bir veri odaklı yöntem sunar. Önemli katkılar arasında bozulmaların alarmlarla ilişkilendirilmesi, bir alarm simülasyon platformu oluşturulması ve alarm parametrelerinin optimize edilmesi yer alır. Çalışma, alarm reaksiyon gecikmesi ile alarm sayısı arasındaki dengeyi vurgulayarak operatörün zamanında yanıt vermesinin önemini vurgulamaktadır.

Tarih: 10.01.2025 / 14:45 Yer: II-06